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細胞系STR鑒定

2024-03-14

產      地:
暫無
所在地區:
上海上海市
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細胞系鑒定即通過STR(短串聯重復)圖譜所建立細胞系的遺傳特征。一株細胞系的遺傳特征確立后,細胞系可以通過定期的檢測,以防止出現細胞系被誤認或交叉污染的情況。


什么時候需細胞系鑒定?

  • 當建立或獲得一個新的細胞系時;

  • 一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時

  • 在細胞凍存之前,或細胞已連續培養2~3個月時

  • 發表文章或申請課題經費前

  • 細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大時

  • 當實驗室使用超過一種細胞系時,所有細胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能


如何進行細胞系鑒定?

細胞系鑒定目前主要依據國際身份認證委員會的標準。依據該標準,可以通過多重熒光PCR技術,對人源8個STR位點以及1個性別決定位點進行檢測。下表為這些位點的遺傳信息。


圖片



STR 基因座位上的等位基因可通過擴增區域內重復序列的拷貝數的不同來區分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。然后通過一定的計算方法,即可根據所得的STR分型結果與細胞STR數據庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。

圖片

采用DSMZ tools進行細胞系比對,其中包含來自于ATCC, DSMZ, JCRB 和 RIKEN數據庫的2455個細胞系STR數據。如果待檢測細胞未收錄于以上細胞庫或這是自行建立的新細胞系將無法進行比對,用戶需根據細胞分型結果自行與其他數據庫進行比對。




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