應用領域 | 醫療衛生,環保,食品,生物產業,制藥 |
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簡介
廣譜微生物及耐藥分析系統,是由杭州柏熠科技有限公司開發的一款面向于微生物病原檢測一線工作人員的一鍵式易操作圖形界面分析系統。本分析系統同時支持Nanopore、Illumina、MGI、Ion torrent以及Pacbio等主流三代、二代高通量測序數據輸入,可實現快速簡單分析,系統提供微生物物種組成及豐度信息鑒定、病原知識庫信息注釋及中文說明、目標物種測序數據提取、組裝與溯源、耐藥與毒力等分析功能,同時內置超過40000種基因組數據及對應病原注釋信息,幫助用戶進行本地化病原微生物分析。
功能介紹
廣譜微生物及耐藥分析系統同時支持Nanopore、Pacbio等三代測序數據和Illumina、MGI、Ion torrent等二代測序數據進行生物信息學分析,具體功能如下:
1.支持用戶樣本臨床信息批量上傳和管理。
2.支持 fast5、fastq 、Pod5及fastq.gz等多種格式的測序數據。
3.支持混樣Nanopore測序數據拆分分析。
4.支持同一任務多個樣本同時分析。
5.支持從下機數據上傳到輸出結果報告一鍵式操作。
6.支持一鍵式生成 PDF 格式分析報告。
7.分析系統分析結果包含:物種分類、序列數統計、病原微生物注釋、目標物種測序數據提取、耐藥元件分析(新建任務時可選,包含基因組覆蓋度、支持序列數、序列一致性、耐藥機理、對應藥物、物種信息等)、毒力因子分析(新建任務時可選,包含基因組覆蓋度、支持序列數、序列一致性、毒力元件分析、致病機理、對應物種信息等)。
8.支持分析數據及結果下載、圖表輸出、病例信息關聯等。
9.系統內置微生物數據庫支持超過 40000 條物種信息條目。
10.分析系統能夠提供國家認可的計算機軟件著作權登記證書或其他知識產權證明。