簡介

流感病毒全基因組分析系統，是一款提供圖形操作界面的流感病毒全基因組測序數據自動化分析系統。相較于常規熒光定量PCR技術，全基因組測序技術具有更強的檢測靈敏度，為流感病毒的鑒定、變異檢測、監測等帶來了技術革命。本系統是流感病毒全基因組測序數據的配套分析系統，兼容當前主流二代和三代納米孔原始測序數據，實現實時快速分析，能夠提供流感病毒分型、甲型流感病毒HA和NA基因區段溯源分析、乙型流感兩種家系（Victoria和Yamagata）分型分析、變異檢測、覆蓋度展示以及組裝完成的基因組序列。

本系統與常規Linux Shell命令行調用多種程序測序數據分析相比，提供從下機數據到結果報告一鍵式操作，解決了命令行操作難度大、數據結果分析可視化復雜等問題。通過高度優化的集成分析流程與完善的數據庫，可將分析時間縮短至10分鐘內。

功能介紹

流感病毒全基因組分析系統可針對二代及三代納米孔測序數據進行生物信息學分析，具體功能如下：

1.支持單樣本和多樣本數據導入分析；

2.提供從下機數據到分析結果一鍵式操作；

3.提供甲乙丙丁四種流感病毒鑒定和基因組變異檢測；

4.內置流感數據庫，提供序列比較分析，支持自上傳樣本共同分析，結果以變異比較列表和系統發育樹的方式展示；

5.提供流感病毒的全基因組覆蓋度圖和組裝完成的一致性序列；

6.甲型流感提供亞型鑒定、HA和NA基因溯源分析；

7.乙型流感兩種家系（Victoria和Yamagata）分型分析，支持疫苗株及其他細分進化樹分析

8.提供結果數據統計以及圖表輸出功能；

9.提供樣本管理系統，支持輸入樣本的具體信息，包括病案信息、取樣信息、臨床診斷信息，支持樣本信息和數據分析管理關聯等；

10.支持一鍵輸出可打印的分析報告，支持圖形和表格等結果的下載和輸出。

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