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WB實驗蛋白marker,內參的重要性不可忽視
閱讀:30537 發布時間:2015-2-12嚴謹的Western Blot實驗設計中要求有良好的參照體系,對實驗結果分析是非常有用。特別是當實驗出現問題時,借助參照體系很容易就可以查出問題所在。良好的參照體系通常包括分子量Marker(用來確定蛋白條帶對應的分子量大小),空白載體對照(如果是誘導表達體系還應該有誘導前的對照),已知量標準產物的正對照;另外還有內參。內參即是內部參照(Internal Control),對于哺乳動物細胞表達來說一般是指由管家基因編碼表達的蛋白(Housekeeping Proteins),它們在各組織和細胞中的表達相對恒定,在檢測蛋白的表達水平變化時常用它來做參照物。蛋白含量是肯定要測的。首先合適的上樣蛋白,western圖才比較比較美觀。而且對于需要半定量的western,那是肯定要測含量后再做western了。
1.marker呢,就相當于一把標尺,用于驗證你的目的蛋白的分子量,比如你的marker上有30和35kD的蛋白條帶,而你的目的蛋白是32kD,跑膠以后你如果看到你的目的蛋白條帶在30和35kD之間,就可以初步斷定是你的目的蛋白。
2. 內參呢,內參也叫看家基因,在組織或細胞中都會表達,且表達量在不同組織或細胞中幾乎是相同的,一般有β-ACTIN,GAPDH等。其作用有二,1. 是看提取蛋白質量的好壞。如果做western的時候,內參照蛋白有條帶,而目的蛋白沒有,說明蛋白的提取和轉膜等步驟沒有問題,是目的蛋白的抗體質量不好或者是稀釋倍數不對。2. 是比較客觀的說明目的蛋白的表達情況,消除上樣量等的誤差。不同的標本之間由于蛋白提取的量有差別,可能強陽性的表達跑出來的帶很弱。因此設立內參照,比較不同標本之間的表達情況。
3. 測一下蛋白濃度再上樣,這樣好點。當然也看你的實驗室是定性還是定量了,定性的話,我覺得可以不用測濃度;要是準備定量,還是盡量保證上樣量一致吧。