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熒光定量PCR(SYBR Green)總RNA提取方法步驟
閱讀:308 發布時間:2023-12-4總RNA提取:
A組織樣本:迅速將新鮮的組織切成合適的大小,在液氮中充分研磨后加裂解液裂解,或直接加入裂解液后用勻漿器勻漿。每30-50mg組織加1ml Trizol。
B全血樣品:加入3-5倍體積的紅細胞裂解液到血樣中,室溫孵育10min,室溫3500rpm離心6min。棄上清,原每2-3ml全血樣品加1mL Trizol。
C細胞樣品:懸浮液中生長的細胞,通過離心收集細胞后,每1×105?106細胞加入1mL Trizol,移液器吹打混勻,直接裂解或-80℃儲存一個月。貼壁生長的細胞,有兩種處理方法。一種是移除培養基后,將1mL Trizol直接加入直徑3.5cm的培養皿中裂解細胞。或是先用胰蛋白酶將貼壁細胞消化下來并收集后,再加入1mL Trizol進行裂解。(Note:加入Trizol前, PBS充分洗滌細胞去除殘余培養基。)熒光定量PCR(SYBR Green)總RNA提取方法步驟如下:
1、直接法
1)加入1ml Trizol試劑,混勻,冰上孵育10min。
2)4℃,12000rpm離心10min,小心轉移上清液到不含顆粒的新EP管中。
3)加入200ul氯仿,劇烈振蕩15秒,室溫孵育5min。
4)4℃,12000rpm離心15min。混合液分三層,包括最下面的苯酚 - 氯仿有機相,中間相和上層水相。小心轉移上層水相到新的EP管(大約60%體積的Trizol),不要吸取中間相,可留下少量上層液體!(Note:質量比數量更重要!)
5)加入等體積的異丙醇,輕輕地顛倒混勻約10次,室溫放置10min。
6)4℃,12000rpm離心10min。棄上清,1ml 75%乙醇洗滌RNA沉淀兩次。
7)4℃,12000rpm離心5min,棄上清,室溫下風干5-10min(不要太干,過度干燥會導致RNA難溶解!)。將RNA溶于15μl-50μlDEPC水中。
8)立即進行反轉錄反應,或先-80℃長期保存。
2、離心柱法(依據RNA提取試劑盒說明書)
1)1、中步驟1)—4)。
2)加入1/2體積的無水乙醇,輕柔顛倒混勻。如有透明的纖維狀物體,不影響下游步驟。
3)將所有裂解物/乙醇混合物轉移至離心柱,置于2mL,靜置2min。4℃,12000rpm離心3min,棄廢液。
4)加入500uL洗滌液,靜置2min。4℃,12000rpm離心30秒,棄廢液。重復一次。
5)4℃,10,000rpm離心2min以除去殘留的乙醇。
6)將離心柱置于新的RNase-free EP管中,加入30ul-50ulDEPC水,靜置5min, 12000rpm離心2min收集。
7)立即進行反轉錄反應,或先-80℃長期保存。