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單細胞水平的miRNA表達譜分析
閱讀:331 發(fā)布時間:2013-10-12單細胞水平的miRNA表達譜分析
Fluidigm在C1系統(tǒng)上實現(xiàn)的第三個單細胞基因組學(xué)應(yīng)用。之前,它推出了單細胞mRNA測序和單細胞基因表達分析。C1系統(tǒng)在去年上市,基于Fluidigm創(chuàng)新的微流體技術(shù),能夠讓研究人員快速可靠地分離單個細胞并進行基因組分析。生物通 www.ebiotrade.com
microRNA(miRNA)這個小小的非編碼RNA分子,行使著重要的調(diào)控功能。研究表明,miRNA可調(diào)控數(shù)千個蛋白編碼基因,從而參與了多個生物學(xué)過程,包括分化、發(fā)育和細胞周期管理。miRNA還與許多常見病存在關(guān)聯(lián),如癌癥和心血管疾病。
研究人員都希望揭開miRNA的更多秘密,然而,miRNA表達譜分析也存在兩方面的挑戰(zhàn)。首先,單個miRNA可靶定多個mRNA靶點,從而調(diào)控多個生物學(xué)系統(tǒng)。這種生物學(xué)現(xiàn)象是細胞間差異的一個促進因素,讓miRNA靶點的解釋變得困難。在單細胞水平研究miRNA的表達讓研究人員可測定同一群體中某些細胞所發(fā)生的快速、動態(tài)變化。其次,傳統(tǒng)的芯片分析費時費力,靈敏度不高,且內(nèi)容不夠靈活。而定量PCR雖提供了比芯片更高的靈敏度,但在大規(guī)模研究時成本高、時間長。生物通 www.ebiotrade.com
如今有了C1系統(tǒng)和miRNA表達譜分析方案,研究人員可在不到24小時的時間內(nèi),平行處理96個單細胞,在一張GE 96.96芯片對每個單細胞分別檢測多達96種miRNA。配套的SINGuLAR™ 2.0分析軟件可以對數(shù)據(jù)進行非監(jiān)督式聚類分析及PCA分析,有效地根據(jù)miRNA表達類型在單細胞水平揭示細胞群體的異質(zhì)性,為研究miRNA調(diào)控提供更多數(shù)據(jù)。
C1單細胞全自動制備系統(tǒng)是*zui先推出的全自動單細胞分離和制備系統(tǒng)。C1系統(tǒng)為每次運行處理96個單細胞提供了簡單輕松、高度重復(fù)的流程,而手工操作所需的時間極少。它地讓分離細胞、提取、逆轉(zhuǎn)錄和擴增過程實現(xiàn)全面自動化,使細胞活性的檢測和分析成為可能,并減少了多平臺技術(shù)錯誤所引起的可變性。單細胞水平的miRNA表達譜分析