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iPSC研究?jī)纱笊衿鳎〔辉试S你不知道

閱讀:723      發(fā)布時(shí)間:2023-3-6
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?誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC,簡(jiǎn)稱為iPS細(xì)胞),是一種由哺乳動(dòng)物成體細(xì)胞經(jīng)轉(zhuǎn)入轉(zhuǎn)錄因子等手段脫分化形成的多能干細(xì)胞,最早由日本學(xué)者山中伸彌的研究團(tuán)隊(duì)于2006年發(fā)現(xiàn)。作為研究發(fā)育或疾病分子機(jī)制的理想研究工具,識(shí)別新治療靶點(diǎn)和高通量藥物篩選方面的廣闊應(yīng)用[1]。

雖然iPSC研究已經(jīng)取得長(zhǎng)足進(jìn)步,但在后續(xù)的研究過程中,仍存在一些挑戰(zhàn)。誘導(dǎo)iPSC生成的過程中,效率低、致瘤性、外源基因插入等問題仍然存在,iPSC誘導(dǎo)向人體組織細(xì)胞的過程中也存在成熟度不足、致瘤性風(fēng)險(xiǎn)等問題,需要培養(yǎng)方法的優(yōu)化以及對(duì)重編程分子機(jī)制的進(jìn)一步研究。要解決這一系列問題,必須通過高通量的研究發(fā)現(xiàn)新的靶點(diǎn)和培養(yǎng)及誘導(dǎo)方法,Incucyte® 實(shí)時(shí)活細(xì)胞分析系統(tǒng)和iQue® 高通量流式細(xì)胞儀可以滿足高通量研究的需求,為iPSC研究插上騰飛的翅膀。

Incucyte®                                                                                                      iQue®


Incucyte® 在iPSC研究中的應(yīng)用

工欲善其事,必先利其器。在iPSC的研究過程中,在不挪動(dòng)細(xì)胞的前提下,Incucyte® 可以實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)時(shí)間實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)iPSC向特定細(xì)胞類型分化的整個(gè)分化過程中細(xì)胞特征的變化,包括細(xì)胞形態(tài)、增殖、凋亡等指標(biāo),并且一次可放6塊培養(yǎng)板,滿足高通量活細(xì)胞成像的要求。

iPSC研究大致有兩個(gè)方向:

優(yōu)化培養(yǎng)條件、誘導(dǎo)體系等以期獲得更穩(wěn)定的iPSC細(xì)胞系;iPSC細(xì)胞呈現(xiàn)克隆生長(zhǎng),為確定不同iPSC細(xì)胞系,哪種在后續(xù)基因編輯以及誘導(dǎo)中更加穩(wěn)定,對(duì)各個(gè)細(xì)胞系實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),通過匯合度計(jì)算增殖情況[7]

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圖1. 候選細(xì)胞系的增殖特征:

A:Incucyte® 記錄不同iPSC細(xì)胞系傳代三天后的圖片;B:3×104 個(gè)細(xì)胞接種48h細(xì)胞消化計(jì)數(shù);C:使用Incucyte® 計(jì)算3個(gè)時(shí)間點(diǎn)匯合度(confluence)來評(píng)估iPSC增殖情況


模擬疾病模型以及分化出更成熟的成體組織細(xì)胞,包括優(yōu)化誘導(dǎo)條件以及改為3D培養(yǎng)等。下面兩篇文獻(xiàn)的Figure展示了向神經(jīng)以及心肌細(xì)胞方向的分化:

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圖2. 體外培養(yǎng)20天的分化神經(jīng)熒光細(xì)胞簇:

在iPSC向神經(jīng)細(xì)胞分化的過程中,用βIII-tubulin (TUJ1) 對(duì)未成熟神經(jīng)元的聚集體進(jìn)行染色,并顯示從(a)陰性對(duì)照聚集體、(b)未加載的微球結(jié)合聚集體、(c)微球結(jié)合聚集體和(d)陽性對(duì)照聚集體[8]。Incucyte® 自動(dòng)拍攝36張單獨(dú)圖像組合而成,用 ImageJ 軟件拼接和裁剪。比例尺:300 μm。

 

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圖3. hiPSC-CM 實(shí)時(shí)凋亡信號(hào)檢測(cè)

心肌分化,作者利用一種新的Metabolic Selected的誘導(dǎo)選擇方法制備缺血性心肌病模型的心肌細(xì)胞,這種模型的心肌細(xì)胞應(yīng)具備Dox毒性敏感特征。利用我們的活細(xì)胞凋亡指示劑[9]實(shí)時(shí)檢測(cè)在加入Dox后心肌細(xì)胞的死亡情況發(fā)現(xiàn)Annexin V+的細(xì)胞比例隨Dox濃度提升死亡比例上升。

 

iQue® 在iPSC研究中的應(yīng)用

 

除Incucyte® 的應(yīng)用外,高通量的研究當(dāng)然少不了我們的iQue® 高通量流式細(xì)胞儀,專為大規(guī)模篩選設(shè)計(jì)。

2020年時(shí),阿斯利康改良Crisper-cas9技術(shù),開發(fā)了一種ObLiGaRe強(qiáng)力霉素誘導(dǎo)型SpCas9(ODInCas9)轉(zhuǎn)基因小鼠模型,靶向ObLiGaRe導(dǎo)致人類或小鼠細(xì)胞的功能整合,最終產(chǎn)生ODInCas9小鼠,并且驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)這種小鼠體細(xì)胞體內(nèi)編輯可以模擬非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC) 腺癌,使治療研究能夠驗(yàn)證候選藥物的功效。在判斷基因編輯成功與否時(shí),應(yīng)用到Incucyte® 檢測(cè)細(xì)胞增殖,并聯(lián)合使用iQue® 及Incucyte® 篩選GFP陽性的細(xì)胞[10]

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圖4. 高通量篩選編輯成功的GFP陽性細(xì)胞:

將各種不同組織細(xì)胞以及iPSC細(xì)胞導(dǎo)入OdInCas9,抗生素篩選后進(jìn)行單克隆挑選培養(yǎng),用Incucyte® 拍照成像,識(shí)別GFP陽性細(xì)胞,為確定是否真正導(dǎo)入OdInCas9,加入Dox誘導(dǎo)GFP表達(dá),細(xì)胞消化后放入96孔板,用我們的iQue® 鑒別GFP陽性細(xì)胞。


除此之外, 賽多利斯對(duì)兩者在iPSC中的應(yīng)用做了一個(gè)簡(jiǎn)單的示例(圖5):

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圖5. iPSC檢測(cè)實(shí)驗(yàn)流程:

1.多能性檢測(cè):iQue® 檢測(cè)iPSC細(xì)胞系多能性標(biāo)記基因表達(dá)并用Incucyte® 檢測(cè)細(xì)胞形態(tài);

2.2D培養(yǎng)時(shí),利用Incucyte® 拍照,iQue® 檢測(cè)表面標(biāo)記基因表達(dá);

3.3D培養(yǎng)21天后,以同樣方法檢測(cè)。

 

而下圖就是一個(gè)很好的案例。

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圖6. 優(yōu)化培養(yǎng)基長(zhǎng)期培養(yǎng)特征評(píng)估:

我們加入一種基礎(chǔ)培養(yǎng)基以及一種優(yōu)化培養(yǎng)基培養(yǎng)ATCC-DYS0100 iPSC細(xì)胞系,并檢測(cè)這兩種情況下的生長(zhǎng)狀況、形態(tài)以及標(biāo)記基因表達(dá)(圖5),可以看到陰性對(duì)照(非多能細(xì)胞)THP1細(xì)胞表達(dá)高水平SSEA-1,低表達(dá)TRA-1-60,陽性對(duì)照NCCIT細(xì)胞恰恰相反(圖6 A),優(yōu)化過培養(yǎng)基在長(zhǎng)期培養(yǎng)到18天時(shí),仍然保持著很強(qiáng)的多能性,而非優(yōu)化培養(yǎng)基隨著時(shí)間推移,逐漸分化。Forecyt分析軟件*的熱圖結(jié)果,清晰地展示18天時(shí)多能性標(biāo)記基因的表達(dá)比例(圖6 B),從而方便地實(shí)現(xiàn)大規(guī)模篩選。Incucyte® 對(duì)培養(yǎng)的擬胚體進(jìn)行觀察,發(fā)現(xiàn)優(yōu)化過的細(xì)胞偏心度遠(yuǎn)低于未優(yōu)化組,更加圓潤(rùn)(圖6 C,D),證明優(yōu)化過的培養(yǎng)基對(duì)于多能性的維持作用明顯。

 

展望未來,利用iPSC這種理想研究工具,可從成千上萬種的藥物中,發(fā)現(xiàn)藥物的新靶點(diǎn)、新作用,乃至發(fā)現(xiàn)新的藥物,誘導(dǎo)出真正替代人體成體細(xì)胞成熟度的細(xì)胞。

 


為什么要用Incucyte®長(zhǎng)時(shí)程細(xì)胞影像分析系統(tǒng)?

 

iPSC異質(zhì)性強(qiáng)對(duì)培養(yǎng)條件要求苛刻,培養(yǎng)箱內(nèi)可長(zhǎng)達(dá)數(shù)周的連續(xù)觀察,最短幾分鐘間隔拍攝,減少人力,防止過多操作對(duì)細(xì)胞的傷害

6個(gè)板位,分別獨(dú)立設(shè)置檢測(cè)程序,可以兼容各種孔板和培養(yǎng)皿,通量高

高效簡(jiǎn)便的模塊化軟件設(shè)置和數(shù)據(jù)分析,輸出圖片、視頻、生長(zhǎng)曲線等多指標(biāo)多參數(shù);本文提到了使用Incucyte® 多個(gè)參數(shù)的調(diào)節(jié),使得結(jié)果更加準(zhǔn)確

大于100種優(yōu)化過的活細(xì)胞專用熒光試劑、耗材及詳盡的Protocol;文章數(shù)大于12000篇,是長(zhǎng)時(shí)間活細(xì)胞成像產(chǎn)品中最多

 

為什么要用iQue® 高通量流式呢?


氣泡分隔的連續(xù)采樣技術(shù),使流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)入高通量篩選(HTS)領(lǐng)域
最小樣本體積達(dá)到10uL,支持384、1536孔板采樣,96孔板只需5min

ForeCyt軟件、比起傳統(tǒng)流式更簡(jiǎn)單的使用及維護(hù),硬件配套軟件,是高通量流式篩選必備儀器。雖然在文章中未提及iQue® 的高通量應(yīng)用

 

《活細(xì)胞監(jiān)測(cè):優(yōu)化高級(jí)細(xì)胞模型的工作流程》


參考文獻(xiàn)

 

[1]Ding M, Clark R, Bardelle C, et al. Application of High-Throughput Flow Cytometry in Early Drug Discovery: An AstraZeneca Perspective[J]. SLAS discovery: advancing life sciences R & D, 2018, 23(7): 719–731.

[2]Zhou M, Wang H, Zeng X, et al. Mortality, morbidity, and risk factors in China and its provinces, 1990–2017: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2017[J]. The Lancet, Elsevier, 2019, 394(10204): 1145–1158.

[3]Takahashi K, Yamanaka S. Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic and Adult Fibroblast Cultures by Defined Factors[J]. Cell, 2006, 126(4): 663–676.

[4]Generation of human-induced pluripotent stem cells - PubMed[EB/OL]. /2022-09-30. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18600223/.

[5]Liu G, David B T, Trawczynski M, et al. Advances in Pluripotent Stem Cells: History, Mechanisms, Technologies, and Applications[J]. Stem Cell Reviews and Reports, 2020, 16(1): 3–32.

[6]Kim J, Koo B-K, Knoblich J A. Human organoids: model systems for human biology and medicine[J]. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2020, 21(10): 571–584.

[7]Pantazis C B, Yang A, Lara E, et al. A reference induced pluripotent stem cell line for large-scale collaborative studies[J]. bioRxiv, 2022: 2021.12.15.472643.

[8]Agbay A, Vega L D L, Nixon G, et al. Guggulsterone-releasing microspheres direct the differentiation of human induced pluripotent stem cells into neural phenotypes[J]. Biomedical Materials, IOP Publishing, 2018, 13(3): 034104.

[9]Davis J, Chouman A, Creech J, et al. In vitro model of ischemic heart failure using human induced pluripotent stem cell–derived cardiomyocytes[J]. JCI Insight, , 6(10): e134368.

[10]Lundin A, Porritt M J, Jaiswal H, et al. ObLiGaRe doxycycline Inducible (ODIn) Cas9 system driving pre-clinical drug discovery, from design to cancer treatment[R]. Genomics, 2020.



 

 

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