【熱點應用】揭秘蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性!
#本文由馬爾文帕納科醫(yī)藥業(yè)務發(fā)展經(jīng)理 韓佩韋博士供稿#
蛋白質(zhì)的熱穩(wěn)定性研究對于加深對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能的了解有著非常重要的意義。差示掃描量熱技術(DSC)是直接測量熱轉(zhuǎn)變過程焓變(ΔH)的分析方法,例如蛋白質(zhì),核酸或其他生物多聚物的熱變性過程,為表征蛋白質(zhì)及其他生物分子的熱穩(wěn)定性建立“金標準"技術。
一、焓變對于蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性意味著什么?
1,什么是焓(hán)變(ΔH)?
ΔH(焓變)是在恒壓狀態(tài)下將系統(tǒng)升高至溫度T過程中攝取的總能量。對于蛋白質(zhì)而言,這意味著用于使蛋白質(zhì)發(fā)生去折疊所花費的能量(熱量),此過程中 ΔH 是為正值,代表這是一個吸熱過程。這種能量與蛋白質(zhì)中所有原子和分子運動相關,以及維系蛋白質(zhì)保持折疊構(gòu)象中的鍵能。
通過將吸熱譜圖下方的面積進行積分(見圖 1)可以計算得到焓變(ΔH)。焓變用每摩爾蛋白質(zhì)的吸收的卡路里(或焦耳)來表示。由于蛋白質(zhì)在 DSC 實驗中暴露于升高的溫度,因此蛋白質(zhì)開始發(fā)生熱變性,并伴隨著非共價鍵的斷裂。焓變(ΔH)與維系蛋白質(zhì)天然(折疊)構(gòu)象中所需的價鍵數(shù)量有關。焓變(ΔH)也取決于我們測量總蛋白質(zhì)濃度的準確程度。如果蛋白質(zhì)濃度不是很準確, 則會影響到計算出的ΔH值。
2,焓變(ΔH)值可以在實踐中告訴我們什么?
當您比較不同蛋白質(zhì)的DSC結(jié)果時,具有較大ΔH值的蛋白質(zhì)不一定比具有較小ΔH的蛋白質(zhì)更穩(wěn)定。由于ΔH值會對蛋白質(zhì)摩爾濃度歸一化,因此該值通常與蛋白質(zhì)的尺寸成比例。大多數(shù)蛋白質(zhì)具有相同的鍵密度(單位體積內(nèi)的價鍵數(shù)量),因此,期待具有較大分子量的蛋白質(zhì)也具有較大的焓變(ΔH)值也是合理的。
3,焓變(ΔH)的決定因素是什么?
焓變(ΔH)取決于溶液中天然蛋白質(zhì)的百分比。
一個非常重要的考慮是DSC僅測量初始處于折疊(天然)構(gòu)象中的蛋白質(zhì)的ΔH值。ΔH值取決于具有折疊(活性)構(gòu)象的濃度。如果初始折疊蛋白質(zhì)組分小于總蛋白質(zhì)濃度(即活性濃度小于100%),則計算出的ΔH值將相應地變小。
下圖顯示了在儲存期間的不同時間測量的相同蛋白質(zhì)的DSC圖譜。藍色曲線圖譜表示新鮮制備的蛋白質(zhì),是100%天然(折疊)蛋白質(zhì)。當?shù)鞍踪|(zhì)樣品在儲存期間發(fā)生部分變性時,溶液中的天然蛋白質(zhì)的比例開始下降,導致DSC圖譜的焓變降低。當我們擁有100%天然蛋白質(zhì)的參考DSC圖譜時,我們可以根據(jù)不同狀態(tài)樣品的相對ΔH值來估計每個樣品中的折疊蛋白質(zhì)比例。
4,如何判斷蛋白質(zhì)是否失活?
到目前為止,我們已提及的焓變是指通過DSC儀器直接測量到的“熱"焓,也就是熱力學焓變,通常表示為ΔHcal,這是其他任何非量熱技術,例如圓二色譜(CD),表面等離子共振(SPR)等技術不能獲取的焓變量。
還有另一種其他技術可以獲取的焓變類型,即范霍夫焓變 - ΔHVH,我們同樣可以通過DSC數(shù)據(jù)計算得出。范霍夫焓變(ΔHVH)可從通過DSC非兩狀態(tài)模型(non-2-state model)擬合得到。
兩種不同的焓變對蛋白質(zhì)熱穩(wěn)定性的測定又有什么實際意義呢?
在DSC技術中,ΔHcal僅由DSC熱轉(zhuǎn)變峰曲線積分的面積來確定,而ΔHVH僅通過熱轉(zhuǎn)變峰曲線的形狀來確定。轉(zhuǎn)變峰形越尖銳,ΔHVH越大,反之亦然。ΔHcal是具有濃度依賴性的,但ΔHVH不是。
若ΔHcal/ΔHVH比例為1,通常意味著所研究的熱轉(zhuǎn)變狀態(tài)符合兩狀態(tài)去折疊(Two-state unfolding model)模型。如果ΔHcal/ΔHVH比例大于1,則意味著存在顯著密集的中間體存在; 而ΔHcal/ΔHVH比小于1,則意味著存在分子間相互作用。
使用ΔHcal/ΔHVH可以幫我們估測是否有很大部分蛋白質(zhì)是失活的。如果我們有一個簡單的單結(jié)構(gòu)域蛋白質(zhì),并且假定沒有中間體,則我們可以預測,其去折疊過程的ΔHcal/ΔHVH的比值不會遠離1。因此,如果ΔHcal顯著低于ΔHVH,可以表明很大部分蛋白質(zhì)已經(jīng)失活。
綜上所述,對DSC中ΔH數(shù)據(jù)的分析可以讓我們了解蛋白質(zhì)的去折疊機制,以及多少蛋白質(zhì)處于其活性的天然構(gòu)象。
二、TM值如何與和蛋白質(zhì)穩(wěn)定性相關?
中點轉(zhuǎn)變溫度TM
我們可以從DSC數(shù)據(jù)中提取多個熱力學參數(shù),例如ΔH,ΔHVH(范霍夫焓變),ΔCP和ΔG,但*泛使用的參數(shù)是TM。順便提一下,這也是最容易和最準確的值 - TM是最大峰值所對應的溫度。
“蛋白質(zhì)穩(wěn)定性"有多種定義。最常見的是,對于工業(yè)上有重要意義的蛋白質(zhì),該術語是指在生理溫度下的功能(或操作)穩(wěn)定性; 即,他們可以在37°C下發(fā)揮多長時間的生物功能?這可以通過需要花幾天或數(shù)周時間的等溫研究來評估,或者,如果使用差示掃描量熱法(DSC),則可以在幾分鐘內(nèi)變性蛋白質(zhì)。
通過DSC獲得的哪個熱力學參數(shù)與功能穩(wěn)定性相關度最佳?事實證明,是TM值。
熱力學穩(wěn)定性(ΔG)是功能穩(wěn)定性的較差的預測因子; 技術上,ΔG僅適用于可逆去折疊過程,此外,它由TM,ΔH和ΔCP計算得到,后者可能很難獲取。
一個例子是TM和ΔG與肉桿菌蛋白抗原血清型C的半數(shù)聚集時間(half time)(作為功能穩(wěn)定性的量度)的相關性,用作模型蛋白。ΔG與T1 / 2 agg. 相關系數(shù)(R)僅為0.4,而TM 與 T1 / 2 agg.的相關系數(shù)是0.92。(來自J Pharm Sci的數(shù)據(jù),2011 Mar; 100(3):836-48)
思考TM的一種方式:
如下圖所示,假設我們用 DSC 掃描兩種不同配方中的蛋白質(zhì)或兩種不同的蛋白質(zhì)構(gòu)建體,則 TM 值向低溫方向 5℃ 的負偏移(穩(wěn)定性下降)實際上反映了在 37℃ 條件下的 Fu (蛋白去折疊比例)由2%增加到 3%。溫度 T 下的 Fu 蛋白可以通過圖像化的方式估算,即溫度 T 以下的曲線下陰影區(qū)域面積和整個曲線下方面積的百分比。
由于聚集體的生成可能是濃度依賴的過程,因此較高濃度的去折疊蛋白質(zhì)(紅色掃描曲線)將導致較快的聚合(更大組分的去折疊狀態(tài)(U)才能轉(zhuǎn)換為不可逆變性狀態(tài)(I)。參見下面的原理圖。
這種解析的一個推論是,曲線的整體形狀應該是相似的。我們假定這種情況是對于在不同配方中的相同蛋白質(zhì)或由一個母分子衍生出來的具有相似構(gòu)建體的蛋白質(zhì)。但是,對于*不同的蛋白質(zhì),使用TM值作為用于穩(wěn)定性比較的預測指標則應該謹慎使用。
擴展閱讀
Differential Scanning Calorimetry (DSC): Theory andpractice
Differential Scanning Calorimetry (DSC) forBiopharmaceutical Development: Versatility and Power
The Power of Heat: Digging Deeper with DifferentialScanning Calorimetry to Study Key Protein Characteristics
PEAQ-DSC 微量熱差示掃描量熱儀:DSC
差式掃描量熱法(DSC)是一種直接分析天然蛋白質(zhì)或其他生物分子熱穩(wěn)定性的技術,無需外在熒光素或者內(nèi)源熒光,它通過測定在恒定的升溫速率下使生物分子發(fā)生熱變性過程中的熱容變化來實現(xiàn)。
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馬爾文帕納科的使命是通過對材料進行化學、物性和結(jié)構(gòu)分析,打造出客戶導向型創(chuàng)新解決方案和服務,從而提高效率和產(chǎn)生可觀的經(jīng)濟效益。通過利用包括人工智能在內(nèi)的最近技術發(fā)展,我們能夠逐步實現(xiàn)這一目標。這將讓各個行業(yè)和組織的科學家和工程師可解決一系列難題,如提高生產(chǎn)率、開發(fā)更高質(zhì)量的產(chǎn)品,并縮短產(chǎn)品上市時間。