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二手測序儀技術(shù)使用指導(dǎo)工作
閱讀:500 發(fā)布時間:2017-9-20
二手測序儀分手工測序和自動測序,手工測序包括sanger雙脫氧鏈終止法和maxam-gilbert化學(xué)降解法。自動化測序?qū)嶋H上已成為當(dāng)今 dna序列分析的主流。
二手測序儀注意事項
1.a(chǎn)bi prism 310基因分析儀是精密儀器,需專人操作、管理和維護。
2.本實驗測序pcr反應(yīng)的總體積是5μl,而且未加礦物油覆蓋,所以pcr管蓋的密封性很重要,除加完試劑后蓋緊pcr管蓋外,選用pe公司的pcr管。如pcr結(jié)束后pcr液小于4~4.5μl,則此pcr反應(yīng)可能失敗,不必進行純化和上樣。
3.作為測序用戶來說,只需提供純化好的dna樣品和引物,一個測序pcr反應(yīng)使用的模板不同,需要的dna量也就不同,pcr測序所需模板的量較少,一般pcr產(chǎn)物需30~90ng,單鏈dna需50~100ng,雙鏈dna需200~500ng,dna的純度一般是a260nm/a280nm為 1.6~2.0,用去離子水或三蒸水溶解dna,不用te緩沖液溶解。引物用去離子水或三蒸水配成3.2pmol/μl較好。
4.本實驗使用的測序試劑盒是bigdye熒光標(biāo)記終止底物循環(huán)測序試劑盒,一般可測dna長度為650bp左右。本儀器dna測序度為 (98.5±0.5) %,儀器不能辨讀的堿基n<2%,所需測定的長度超過了650bp,則需設(shè)計另外的引物。二手測序儀為保證測序更為準(zhǔn)確,可設(shè)計反向引物對同一模板進行測序,相互印證。對于n堿基可進行人工核對,有時可以辨讀出來。為提高測序的度,根據(jù)星號提示位置,可人工分析該處彩色圖譜,對該處堿基作進一步核對。