華雅旗下紅榮微再授權(quán)代理TAKARA Rubicon單細胞擴增文庫構(gòu)建產(chǎn)品

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Rubicon-ThruPLEX® DNA-seq Kit

產(chǎn)品英文名稱：ThruPLEX® DNA-seq Kit

產(chǎn)品中文名稱：Illumina測序文庫構(gòu)建試劑盒

用途：WGS，WES，靶向測序，ChIP-seq，RNA-seq

保存：-20ºC

ThruPLEX DNA-seq Kit 基于新的ThruPLEX 技術(shù)，可以低至50 pg的DNA起始構(gòu)建DNA文庫，在提高靈敏度的同時可以構(gòu)建多達96種illumina index引物文庫。本試劑適用于多種樣品來源的片段化DNA樣品，基因組DNA或體液樣品如游離DNA，F(xiàn)FPE樣品來源DNA和cDNA。ThruPLEX DNA-seq Kit 整體流程可以在單管或單孔中進行，約2個小時即可完成，無需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟。試劑盒提供12、48或96種Illumina單端或雙端index引物，該系列引物保存在反應(yīng)管中(6或12)或預(yù)分裝密封于條形碼標(biāo)記的微孔板中。ThruPLEX DNA-seq Kit 可以用于DNA-seq，RNA-seq，ChIP-seq，并且可以兼容主流平臺實現(xiàn)強有力的目標(biāo)區(qū)域富集。

ThruPLEX® DNA-seq Kit builds on the innovative ThruPLEX chemistry to generate DNA libraries from as little as 50 pg of DNA and increases sensitivity while providing up to 96 indexes for multiplexing. This kit can be used with fragmented DNA from any sample source – genomic, biofluids such as cell-free DNA, DNA from FFPE materials and cDNA. The entire ThruPLEX DNA-seq Kit workflow is performed in a single tube or well in about 2 hours and requires no purification steps or sample transfers. Kits contain 12, 48 or 96 single- or dual-read Illumina-compatible indexes either in tubes (6 or 12) or pre-dispensed and sealed in barcoded microplates. ThruPLEX DNA-seq Kit can be used in any DNA-seq application, RNA-seq, ChIP-seq and offers robust target enrichment performance with all of the leading platforms.

產(chǎn)品特點

高靈敏度、高性能：以低至50 pg至50 ngDNA為起始材料

完整的文庫構(gòu)建試劑：優(yōu)化的illumina index引物和接頭試劑、酶、緩沖液及無核酸酶水

快速簡便的工作流程：單管或單孔3步操作，2小時，無需轉(zhuǎn)移操作

兼容主流目標(biāo)區(qū)域富集平臺：Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ及 IDT xGen® Lockdown® probes

 ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容

產(chǎn)品應(yīng)用

WGS（全基因組測序），WES（全外顯子組測序），靶向測序，ChIP-seq，RNA-seq

ChIP-seq應(yīng)用特別介紹

ChIP-seq引用文獻

2016至今有11篇ThruPLEX用于ChIP-seq 的高影響因子文章發(fā)表。

• 應(yīng)用領(lǐng)域

– 發(fā)育和干細胞生物學(xué)

– 腫瘤研究

ChIP-seq–分析蛋白與DNA的相互作用，確定結(jié)合位點

• 很多實驗涉及活檢樣品和稀有細胞群（干細胞，原代細胞等）

• 主要的挑戰(zhàn)是以微量DNA樣品構(gòu)建NGS文庫

ThruPLEX技術(shù)原理

技術(shù)要點：莖環(huán)形接頭

莖環(huán)形接頭的特別設(shè)計，免去了大多數(shù)Illumina等文庫制備技術(shù)需要的中間純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應(yīng)管、2個小時、3步反應(yīng)的簡單過程。僅在PCR反應(yīng)后進行1次磁珠純化，純化造成的樣品損失低，可對珍貴樣品進行有效分析。

簡單的工作流程：一管反應(yīng)

產(chǎn)品使用

組份：

分模板準(zhǔn)備、文庫合成和文庫擴增三大部分。保存-20℃。

Template Preparation Buffer 模板準(zhǔn)備緩沖液（紅色）

Template Preparation Enzyme 模板準(zhǔn)備酶（紅色）

Library Synthesis Buffer文庫合成緩沖液（黃色）

Library Synthesis Enzyme文庫合成酶（黃色）

Library Amplification Buffer文庫擴增緩沖液（綠色）

Library Amplification Enzyme文庫擴增酶（綠色）

Nuclease-Free water 無核酸酶水（無色）

Indexing 試劑（藍色）

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自備試劑：

PCR管或96孔PCR板和密封件

低吸附濾芯槍頭

新鮮制備的80％（v / v）乙醇

Agencourt®XP 核酸純化磁珠（Beckman Coulter，目錄號A63880）

可選試劑：

KAPA®Library Quantification Kit-Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)

EvaGreen® Dye, 20X in water (Biotium, CAT. NO. 31000-T)

Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories,）

產(chǎn)品性能

ThruPLEX DNA-seq Kit 優(yōu)于其他NGS文庫制備試劑。與其他試劑相比，ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA，構(gòu)建多樣性更好（左圖），重復(fù)更少（右圖）的文庫（25 M read pairs）。NGS文庫分別采用圖示對照gDNA起始量，以相應(yīng)的文庫制備試劑制備，采用MiSeq v3 flow cell測序。

ThruPLEX DNA-seq Kit 減少了GC偏差。以人類基因組相對覆蓋度為GC含量（%）的函數(shù)（50 ng DNA起始）。（左圖）ThruPLEX DNA-seq Kit 在整個范圍內(nèi)都有出色的覆蓋。（右圖）ThruPLEX DNA-seq Kit （金色）與參試的其他試劑一樣好或更好。請注意，在這些圖中的覆蓋度應(yīng)該為1。人類基因組中的GC含量分布以紅色柱形圖表示。

訂購信息

Rubicon公司成立于2000年，總部位于美國密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù)，檢控嚴格，擁有cGMP級生產(chǎn)能力，是單細胞測序文庫構(gòu)建的。2017年1月，Rubicon 成為Takara的一員，并且發(fā)展良好。

華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司主營細胞治療和精準(zhǔn)醫(yī)療等產(chǎn)品，2018年與TAKARA繼續(xù)合作，授權(quán)代理（上海）其旗下Rubicon單細胞文庫構(gòu)建試劑等產(chǎn)品。