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通常醫學檢驗方法是基于光譜的分析，而質譜是運用電磁學原理，對荷電分子、亞穩分子碎片進行分離、分析，與光譜學分析*不同。隨著質譜技術的發展，質譜在質檢、環境、臨床檢驗中的應用越來越廣泛。
質譜的特征
準確
快速
高通量
微量
檢測成本低
能夠分析分子結構
質譜儀的工作原理
質譜儀是按照離子的質荷比（m/z）不同，來分離不同分子量的分子.測定分子量進行成分和結構分析。
離子的生成方式有失去或捕獲電荷（如：電子發射，質子化或去質子化）
根據質量分析器的工作原理，常見的質譜儀可以分為：
磁偏轉
飛行時間
四極桿
離子阱
傅立葉變換
串聯質譜儀：時間串聯、空間串聯
應用范圍主要包括這四個方面：
1.新生兒遺傳代謝性疾病篩查
2.氨基酸檢測
3.治療藥物濃度檢測
4.其他，如維生素D、葉酸