詳細介紹
本試劑盒采用的裂解液,可快速可靠的從細胞、動物組織、植物組織、病毒液樣本、抗凝全血、培養細菌中純化出高純度的總 RNA。該試劑盒是目前國際上操作步驟最少、用時最短的 RNA 提取試劑盒(最快 5 分鐘)。應用本試劑盒提取的 RNA 可直接用于反轉錄、基因克隆、定量檢測、文庫構建、雜交等多種分子生物學實驗。
商品屬性:
產品名稱 | 規格 | 貨號 |
5min極速RNA提取試劑盒 | 50T | A-PJ1070 |
注意事項:
(1) 本試劑盒中的 Washing Buffer 中已經加乙醇,無需單獨添加。
(2) RNA LB1 和 RNA BB2 均具有腐蝕性,注意防護。操作方法
(1)裂解/上柱(1.5ml EP 管中處理)培養細胞:消化完畢后,離心收集細胞沉淀,用 20~30μl 水或PBS 重懸細胞沉淀(務必重懸充分)。加入 120μl RNA LB1 漩渦混勻 30s(有未溶解的細胞團塊,用槍頭吹打,助溶解),加入 500μlRNA BB2 上下顛倒混合均勻,倒入吸附柱中。13000rpm 離心 30s,倒掉廢液,進行后續洗滌/洗脫步驟。
組織樣品----采用研缽進行研磨:用液氮研磨粉碎組織樣本,將研磨粉碎的樣品加入到 200μl RNA LB1 中,漩渦混合均勻 1min(有塊狀組織未溶解的,要使用槍頭吹打,助消化),加入 500μl RNABB2 上下顛倒混合均勻,13000rpm 離心 15s。將上清倒入吸附柱中(動作需輕柔,勿將未消化的組織塊倒入吸附柱),13000rpm 離心 30s,倒掉廢液,進行后續洗滌/洗脫步驟。
組織樣品----采用鋼珠進行研磨:將組織樣品加入到 300μl RNALB1 中(1.5ml EP 管),并加入幾粒鋼珠,置于組織研磨儀中,研磨 1~2min。向研磨后的勻漿液中加入 750μl RNA BB2,漩渦混勻5s,13000rpm 離心 1min。用 1ml 吸頭吸取 750μl 上清液到吸附柱中。13000rpm 離心 30s,倒掉廢液,進行后續洗滌/洗脫步驟。注意:植物組織的勻漿效果通常較動物組織差一些,所以一般推薦采用液氮條件下研缽來研磨。在采用鋼珠研磨的條件下務必將組織研磨粉碎,否則會導致產率降低。病毒液 /體液 /血清 /血漿:吸取 150μl 病毒液/體液樣品到加入到120μl RNA LB1 中,漩渦混合均勻 30s。直接加入 500μl RNA BB2中,漩渦混合均勻 15s。倒入吸附柱中,13000rpm 離心 30s,倒掉廢液,進行后續洗滌/洗脫步驟。
培養細菌:收集菌體后,用 20~30μl 水重懸菌體(務必重懸充分),加入 120μl RNA LB1 漩渦混勻 30s,加入 500μl RNA BB2 上下顛倒混合均勻,倒入吸附柱中。13000rpm 離心 30s,倒掉廢液,進行后續洗滌/洗脫步驟。
(2) 洗滌和洗脫
向吸附柱中加入 500μl Washing Buffer,13000rpm 離心 15s。重復此步驟一次。 將吸附柱重新放回離心機,13000rpm 空離心1min,將殘留的乙醇甩干。 將吸附柱芯放入到 2mL NucleaseFree 收集管中,向吸附柱芯中加入 20~50μl Nuclease Free H2O,室溫放置 1min,13,000rpm 離心 1min,洗脫液即為提取的 RNA,冷凍保存。
PCR基本步驟及注意事項?
一、實驗原理
PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,它類似于生物體內DNA的復制。在生物體內DNA復制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設計的特定序列,實現對特定位置的擴增;PCR Buffer提供一個反應的緩沖環境;反應過程同生物體內一樣,DNA雙鏈打開,引物結合模板,延伸形成新鏈。而這些過程在生物體內靠DNA解旋酶解鏈,而在體外在通過控制反應溫度實現的。如常用94℃變性模板DNA打開雙鏈,在退火溫度處引物結合到模板上,最后在72℃完成延伸,并反復重復此過程即可實現對特定片段DNA的大量擴增。到第三循環開始才產生出和靶DNA區段相同的DNA分子,進一步循環地產生出靶DNA區段的指數加倍。
在擴增后期,由于產物積累,使原來呈指數擴增的反應變成平坦的曲線,產物不再隨循環數而明顯上升,這稱為平臺效應。平臺期(Plateau)會使原先由于錯配而產生的低濃度非特異性產物繼續大量擴增,達到較高水平。因此,應適當調節循環次數,在平臺期前結束反應, 減少非特異性產物。到達平臺期(Plateau)所需循環次數取決于樣品中模板的拷貝。
二、主要的成分
1.模板可以是多種形式,主要包括基因組DNA、質粒DNA、攜帶病毒的基因組DNA、PCR產物,cDNA等,但不能為RNA。對于不同類型的模板,其主要不同在于預變性的時間以及模板的量。一般對于大的基因組DNA預變性時間10min足夠,質粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預變性2min、PCR產物預變性2min即可。
注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,只不過在第一輪循環時只有一個引物結合,合成另一條鏈。從第二輪開始,兩個引物均與特異位點結合,從而實現了與常規PCR的接軌。而同作為單鏈的RNA卻不能進行PCR擴增,原因就在于實現PCR反應的是DNA聚合酶,只能特意識別DNA鏈。
2.對于模版的量來說,一般25ul體系DNA的質量為50—100ng。對于基因組DNA由于其結構比較復雜,提取的濃度也往往比較大,為防止濃度過大對PCR造成影響,故需對提取的DNA進行梯度稀釋。否則濃度過高則可能會引起非特異性擴增。對于質粒及PCR產物由于其結構簡單,且提取濃度一般較低,則無需稀釋。
PCR實驗中應該注意的問題有哪些?
沒有ct值
檢測結果遇到沒有Ct值情況,排查是否有以下問題:
1、循環數不夠(一般不超過45循環,不僅背景值提高,定量也不準);
2、PCR程序設置錯誤,檢測熒光信號的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時采集,TaqMan法則一般在退火結束時或延伸時采集信號,另外熒光采集是否選中;
3、引物或探針降解。可通過PAGE電泳檢測引物和探針是否降解;
4、模板量可能降解或上樣量不足(不超過500ng,根據試劑盒說明書即可), 對未知濃度的樣本應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發生模板降解,應考慮樣本準備中雜質的引入及反復凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲備,避免反復凍融;
5、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內含子,以確保擴增基因組DNA;上下游引物Tm值超過4℃以上也會影響擴增)。
ct值過晚
在相對定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對定量中, 對低拷貝數的樣品,Ct值會增大, 但是一般不宜超過40循環, 否則定量不準確。
因此,判斷Ct值出現過晚是否屬于非正常情況, 需要根據具體實驗設計和目的進行。
1、擴增效率低。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進行優化;引物或探針設計不合理, 需要重新設計;
2、PCR程序不合適, 改用三步法進行反應, 或者優化退火/延伸溫度, 可以適當降低退火溫度; 退火/延伸時間短(可以在推薦的時間條件下延長10s);
3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等。PCR各種反應成分的降解或加樣量的不足;
4、PCR產物太長。PCR產物設計超過500bp;
5、模板中存在抑制物。用高純度模板進行PCR檢測或將模板進行稀釋。
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