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轉錄組測序研究服務科研實驗技術服務介紹
閱讀：32 發布時間：2024-9-18lncRNA測序
簡介
長鏈非編碼RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是指長度在200~100000nt之間不具有蛋白編碼功能的RNA分子。它們存在帶polyA尾和不帶polyA尾兩種形式，具有跨物種的低保守性，組織特異性表達和豐度低等特點。lncRNA的種類遠遠超過編碼RNA，保守估計哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產生lncRNA轉錄本，而相應的蛋白編碼RNA的比例僅是1%~5%。目前研究提示lncRNA的功能機制主要包括參與轉錄調控、轉錄后調控、蛋白質運輸和mRNA降解。lncRNA已經成為非編碼RNA研究領域的一個熱點，借助高通量測序，研究人員能夠快速獲得與疾病或者特定生物學過程相關的lncRNA并進行深入研究。
流程圖
技術優勢
1、信息完善：去rRNA的建庫方法，使得一個文庫可以同時進行lncRNA和mRNA的分析，節省了實驗成本；
2、準確度高：鏈特異性建庫方法，使得反義lncRNA的鑒定更加準確；
3、前瞻性好：能發現大量未知的lncRNA信息，適合各類物種的研究；
4、完整性：獲取完整的lncRNA轉錄信息。
smallRNA測序
簡介
smallRNA是生命活動重要的調控因子，在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA，晶能生物公司可以提供各類smallRNA的測序服務。
1、miRNA:是一種長度為21～25nt的單鏈小分子RNA。它廣泛存在于真核生物中，成熟的miRNA是由具發夾結構單鏈RNA前體（premiRNA）經過Dicer酶加工而成，主要通過與靶標基因不wan全互補結合來調控靶基因的表達。miRNA在細胞發育、生物標志物、腫瘤等多個領域中有廣泛的應用。
2、piRNA:是一類長度為26～31nt單鏈的小RNA，大部分集中在29～30nt。piRNA的表達具有組織特異性，只存在于具有全能性的動物細胞，如生殖細胞、腫瘤細胞和干細胞等。piRNA通過與Piwi亞家族蛋白結合形成piRNA復合物（piRC）來發揮生物學功能（沉默轉錄基因過程，維持生殖系和干細胞功能，調節翻譯和mRNA的穩定性）。此外，piRNA在一些癌癥細胞中存在異常表達的現象，提示piRNA可能參與癌癥的發生，并可作為癌癥診斷和治療中的潛在生物標記物。
3、siRNA：內源性干擾小RNA（siRNA,SmallinterferingRNA），包括ta-siRNA、ra-siRNA和nat-siRNA。ta-siRNA：天然反義轉錄小干擾RNA，由TAS基因編碼，miRNA剪切產生，21nt，作用機制類似于miRNA；ra-siRNA：由重復序列、轉座子、異染色質產生，多為24nt；nat-siRNA：由天然反義轉錄本（序列與同區域互補鏈上基因的mRNA方向相反且發生部分重疊）產生。siRNA的功能主要與植物脅迫和生物發育相關。
流程圖
技術優勢
1、完整性好：一次實驗可以同時檢測多種smallRNA,信息來源于數據庫同步；
2、可靠性強：高數據量保證不同豐度smallRNA都能準確定量；
3、前瞻性好：能發現未知的smallRNA信息，適合所有物種的研究。
環狀RNA測序
簡介
環狀RNA測序是新興的轉錄組測序技術。過去普遍認為細胞內的非編碼RNA多以線型存在，近年來越來越多的研究發現，環狀RNA在哺乳動物細胞內的表達量遠高于普遍認識水平。環狀RNA可以參與基因的表達調控，例如封閉miRNA的作用、調節本位基因的表達等，是長鏈非編碼RNA研究中的一個新的研究熱點。
流程圖
