碘化丙啶PI染色液在某些特定情況下可用于檢測細胞凋亡、普通核染色和雙鏈DNA染色。染色后可用熒光顯微鏡或流式細胞儀檢測，碘化丙啶是一種DNA結合染料。其激發和發射波長分別為488nm和630nm。它產生紅色熒光，但沒有膜通透性，不能穿透活細胞膜。它只能染色死細胞。因此，在熒光顯微鏡下，正常細胞不能著色，早期凋亡細胞呈弱紅光，晚期凋亡細胞呈強紅光，壞死細胞呈強紅色熒光。流式細胞儀還可用于分析細胞形態變化對光散射特性的影響，也可與RNaseA結合進行細胞周期分析。
碘化丙啶PI染色液染色步驟：
1、用PBS或適當的緩沖液制備10-50MPI溶液。
2、向細胞培養物中加入1/10細胞培養基體積的PI溶液。
3、將細胞在37C下孵育10-20分鐘。
4、用PBS或適當的緩沖液清洗細胞兩次。
5、用熒光顯微鏡觀察細胞。激發波長為535nm，激發波長為617nm。
碘化丙啶PI染色液在多色熒光中的應用：碘化丙啶(PI)是一種細胞不可滲透的核酸包埋染料。由于Pi被排除在活細胞之外，它通常用于選擇性地染色混合的活細胞和死細胞群中的死細胞。
PI用作紅色熒光核酸染料；PI與核酸結合后熒光增強20～30倍；PI在所有類型的細胞中都具有死細胞特異性，包括哺乳動物細胞、細菌和酵母；PI與流式細胞術和熒光顯微鏡兼容。PI進入細胞與DNA和RNA結合后，熒光增強20～30倍。PI可用于流式細胞術和熒光顯微鏡。PI也可用作多色熒光成像的雙染色，但核特異性染色需要消化細胞RNA。
