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RNeasy FFPE Kit Print
從福爾馬林固定、石蠟包埋的組織切片中純化總RNA
創(chuàng)新的方法用于克服福爾馬林造成的交聯(lián)
有效的釋放RNA而不破壞其完整性
高效的實(shí)驗(yàn)方案,在85分鐘內(nèi)即可獲得純化的RNA
RNeasy FFPE Kit專為從福爾馬林固定、石蠟包埋的組織切片中純化總RNA而設(shè)計(jì)。*的裂解和孵育條件逆轉(zhuǎn)福爾馬林對(duì)RNA的修飾。并且裂解緩沖液可將RNA從組織切片中有效釋放出來,防止RNA的進(jìn)一步降解。試劑盒同樣使用
用福爾馬林固定組織會(huì)導(dǎo)致RNA-RNA和RNA-蛋白質(zhì)的交聯(lián),這會(huì)影響RNA在酶學(xué)分析中的性能。FFPE樣本固定和包埋同樣會(huì)導(dǎo)致核酸的嚴(yán)重片段化。RNeasy FFPE Kit提供了*的裂解和孵育條件來逆轉(zhuǎn)福爾馬林對(duì)RNA的修飾。裂解緩沖液能使RNA從FFPE組織樣本中有效釋放,并防止進(jìn)一步的RNA降解。經(jīng)優(yōu)化的條件能純化得到所有可用的RNA,使用RNeasy FFPE Kit從FFPE樣本中得到的RNA的產(chǎn)量比其他方法更高。
整個(gè)RNeasy FFPE操作流程可在85分鐘內(nèi)完成(參見"RNeasy FFPE procedure")。使用蛋白酶K裂解樣本僅需15分鐘。裂解后,樣本在80oC下孵育15分鐘。之后,用DNase處理能有效去除樣本中的基因組DNA,包括小的DNA/片段。后,使用RNeasy MinElute離心柱即可收集純化的RNA,洗脫體積14–30 µl。
RNeasy FFPE Kit可純化FFPE 樣本中所有大于70 nt RNA,得到適用于RT-PCR等眾多下游應(yīng)用的RNA/片段。但是,從FFPE樣本中純化得到的RNA會(huì)嚴(yán)重片段化,不能用于需要完整RNA的下游應(yīng)用。如果使用片段化RNA可能需要做些修飾(例如在RT-PCR時(shí)設(shè)計(jì)小的擴(kuò)增子)。進(jìn)行cDNA合成時(shí),不能使用oligo-dT引物,而要使用隨機(jī)或基因特異性引物。
技術(shù)指標(biāo)
特征 | 技術(shù)指標(biāo) |
應(yīng)用 | PCR,qPCR,實(shí)時(shí)RT-PCR,微陣列 |
洗脫體積 | 14–30微升 |
規(guī)格 | 旋轉(zhuǎn)柱 |
主要樣本類型 | FFPE組織樣本 |
處理 | 手動(dòng)(離心),自動(dòng)化(QIAcube) |
純化總RNA、miRNA、poly A+ mRNA、DNA或蛋白 | 核糖核酸 |
樣本量 | 1 * 5 µm至4 * 10µm切片 |
技術(shù) | 二氧化硅技術(shù) |
每次運(yùn)行或制備時(shí)間 | 70分鐘 |
產(chǎn)量 | 變化 |