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產地類別 | 進口 | 應用領域 | 醫療衛生,化工,生物產業,制藥,綜合 |
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高通量DNA合成儀
Oligo高通量DNA合成儀特點:
l 包括一個靈活的合成協議編輯器,它允許操作員修改所包含的協議,并將它們保存在一個新名稱下,或者從頭開始編寫協議。協議編輯可以在Excel中完成。對于不同的合成規模和序列長度,很容易編輯特殊協議。比如,可以給耦合緩慢的堿基對一個特別的延長的耦合時間。如果必要的話,可以給所有單體額外的耦合反應時間。
l 軟件簡單易用。在計算機或平板的Excel表中
l 軟件簡單易用。在計算機或平板的Excel表中創建運行數據后,可使用Wi-Fi等網絡連接或標準U盤傳輸到儀器上。實驗運行中,可以從PC端收集實驗數據監測實驗結果。
l 性能
OligoMaker X12可以在1小時內平行合成12條20對的寡核苷酸。
OligoMaker 48可以在2小時內平行合成多達48條20對的寡核苷酸。
OligoMaker 96可以在3小時內平行合成多達96條20對的寡核苷酸。
OligoMaker 192可以在4小時內平行合成多達192條20對的寡核苷酸。
l 可在IUPAC-IUB標準規則下合成10、50、200和1000nmol規模的核苷酸。
兩個反應盤,一個盤可以加載和合成核苷酸,另一個盤準備進行凈化步驟。
OligoMaker 48可以升級為OligoMaker 96和OligoMaker 192;
OligoMaker 96可以升級為OligoMaker 192。
DNA的固相合成。即DNA3'端固定于基質上,然后沿3'向5'方向依此添加核苷酸直至合成所需的DNA片段。不同于應用DNA聚合酶的DNA合成。
合成過程
*個堿基的3‘末端固定在樹脂上,下一個堿基的5’-OH用二對甲氧三苯甲基DMT保護,堿基上的氨基用苯甲酸保護,然后對3‘-OH用氨基磷酸化合物進行活化。
1。1個堿基的5’-OH和下個堿基的3‘-OH形成亞磷酸三酯,
2。然后用碘氧化成磷酸三酯
3。加入C2H6CL2除去第二個堿基5’-OH上的保護劑DMT
循環進行加入下一個堿基
合成完畢后
亞磷酰胺寡核苷酸合成為例介紹該類儀器的一般操作步驟。亞磷酰胺DNA合成的試劑有:保護堿基的5/—DMT,A、G、C、T亞磷酰胺單體,四唑偶聯催化劑,乙酐,N—甲基咪唑封閉試劑,TCA脫保護溶液,12氧化混合物,乙腈清洗溶劑,氨水切除溶液。使用步驟如下:
1、仔細檢查合成儀上所有試劑瓶中的試劑量,必要時換掉試劑瓶,特別注意乙腈的量,因為該溶劑用量較大。
2、將標記好的清潔的收集瓶裝在合成儀上。
3、將要合成的DNA序列輸入合成儀。
4、檢查選擇的合成步驟是否正確。
5、選擇結束方法:TritylOffAuto是儀器的原始狀態,若打算以5,—DMT基團連接純化寡核苷酸,將其轉變為TritylOnAuto結束狀態。
6、選擇結束方法,一般為系統的原始狀態。
7、在每個柱監視器的Username下,輸入你所希望的保存名字。
8、以代碼代替相應的DNA序列標記每一個收集瓶。
9、打印出每一個柱設置的詳細資料。
10、檢查打印出來的資料是否正確。
11、運行StartColumn步驟檢查每一個柱的位置,確保合成儀上合成柱處于正確的位置。
12、檢查連接在合成儀上的溶劑殘留(廢液瓶)是否充滿。
13、如果分部收集器用來收集每個DMT脫保護步驟的流出物,確保試管充分清潔干凈,并打開分部收集器,確保DMT廢液管路通向分部收集器。
14、啟動循環,運行開始程序清洗試劑管路,除去原來的試劑。
注意:TritylOnAuto表示在合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個DMT,并將其從固相載體上切下來,儲存在收集瓶中;TritylOffAuto表示在合成寡核苷酸的5,端核苷酸沒有保護基團,將其從固相載體上切下來,儲存在收集瓶中;TritylOnManual表示合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個DMT,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,而是保留在合成柱中;TritylOffManual表示在合成寡核苷酸的5,端核苷酸沒有保護基團,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,而是保留在合成柱中。
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