蛋白Marker是蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn),是一些已知分子量的蛋白質(zhì)的混合物,像“尺子"一樣用來(lái)指示蛋白質(zhì)條帶的大小。那么如何區(qū)分非預(yù)染蛋白Marker和預(yù)染蛋白Marker呢?讓我們一起來(lái)看看吧!
非預(yù)染蛋白Marker:
是幾種已知分子量并純化好的蛋白質(zhì)預(yù)混液,方便不同大小的蛋白比較。非預(yù)染的Marker使用上不如預(yù)染Marker好用,因?yàn)殡娪具^(guò)程中完quan看不到,電泳結(jié)束后經(jīng)過(guò)蛋白染色后才能起指示作用,無(wú)法在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中起預(yù)示參照作用,屬于“后知后覺"型的。但是由于蛋白沒有附帶染料分子或者是標(biāo)記分子,所示大小正好是蛋白原本的大小,所以比較準(zhǔn)確,可以精確判斷蛋白大小。
預(yù)混的Marker通常有幾條帶加倍濃度作為指示,因?yàn)榛旌系臈l帶越多,越不好記,誰(shuí)知道哪條是那條!數(shù)到眼都花了。所以當(dāng)看到特別濃的那幾條標(biāo)志帶就記得是哪里了。不過(guò)要記得,小帶通常都不那么容易看清楚的。在選擇上來(lái)說(shuō),當(dāng)然是選擇其中至少有一條條帶和自己的目的蛋白大小相近的最好,越近越好。
預(yù)染蛋白Marker是純化好的一些蛋白,通過(guò)與染料共價(jià)耦聯(lián)后混合在一起,在電泳過(guò)程中或者轉(zhuǎn)膜時(shí)可以直接觀察到。
預(yù)染蛋白Marker:
預(yù)染蛋白Marker的出現(xiàn)方便了我們的實(shí)驗(yàn),這種蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)可以幫助我們?cè)陔娪緯r(shí)、電泳后,以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測(cè)電泳情況和估計(jì)遷移率——比如,已知垂直電泳最佳分辨區(qū)域大約在膠的2/3處,如果使用預(yù)染Marker就可以預(yù)測(cè)目標(biāo)蛋白進(jìn)入最佳分辨區(qū)時(shí)停止電泳以得到最佳分辨效果;如果觀察到Marker電泳異常也可以及時(shí)終止電泳;另外在Western Blot轉(zhuǎn)膜以后可以直接觀察蛋白轉(zhuǎn)膜是否完quan,還可以在膜上標(biāo)記蛋白分子量,所以吸引了許多實(shí)驗(yàn)室人員購(gòu)買預(yù)染蛋白標(biāo)準(zhǔn)。
值得注意的是,預(yù)染蛋白Marker與染料共價(jià)耦聯(lián),所以在不同的緩沖條件下電泳時(shí)遷移特性可能會(huì)發(fā)生某些變化,可能導(dǎo)致一些偏差,所以不太適合精確定位蛋白——不過(guò)多數(shù)情況下Marker的條帶未必能和我們的目標(biāo)蛋白完quan一樣,我們得到的也不過(guò)是一種相對(duì)Marker指示的參考大小,最后都需要Western來(lái)定性,所以如果不是要區(qū)分大小相近的條帶,預(yù)染Marker還是很好用的,而且也可以和未染色的蛋白標(biāo)準(zhǔn)一起使用。
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