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DYKDDDDK-Nanoab-Magnetic Beads
貨號:FNM-25-1000
儲存條件:可在4℃保存1年(確保wan全密封),避免離心,干燥和凍融。
產品描述:
偶聯anti-Flag-tag納米抗體的磁性納米微球用于免疫沉淀Flag-tag融合蛋白。
產品優勢:
沒有普通抗體的輕鏈和重鏈,背景干凈;
即用型,節約時間;
高親和力,高載量。
應用范圍:
可用于免疫沉淀(IP)/免疫共沉淀(CoIP)、染色質免疫沉淀(ChIP)/RNA結合蛋白免疫沉淀(RIP)、酶活性測定、質譜分析等。
特異性
特異性結合位于融合蛋白N-端、C-端及內部的Flag-tag。
產品特性:
存儲緩沖液:PBS(含有20%乙醇)。
保存條件:可在4℃保存1年(確保wan全密封),避免離心,干燥和凍融。
DYKDDDDK-Nanoab-Magnetic 實驗步驟:
收集細胞
每個免疫沉淀反應大約使用 106-107 個表達Flag-tag融合蛋白的細胞,可根據Flag-tag融合蛋白表達量適當調整細胞數。
吸出培養基,向培養皿中加入預冷的1×PBS,漂洗2次,利用細胞刮或yi酶消化收集貼壁細胞,細胞轉移到離心管,500g離心3分鐘并丟棄上清液。
植物組織裂解處理:
取適量植物組織樣本(葉片等)放置于冷凍液氮中,之后將冷凍后得植物組織樣本放于研缽進行研磨,盡可能充分研磨破壞其細胞壁。加入500-1000ul RIPA 裂解液(已加蛋白酶抑制劑 PMSF 等)進行裂解,為了提高裂解效率,加入 200ul 玻璃粉充分震蕩 30min,裂解完成后 12000 rpm,離心 30min,吸取上清 置新的離心管中,棄去沉淀。
細胞裂解:
1.在裂解緩沖液中加入蛋白酶抑制劑,用500μl預冷的裂解緩沖液重懸細胞。
2.置于冰上30分鐘,可每10分鐘充分吹打一次。
3.4℃,20,000g離心15分鐘,將裂解產物(上清)轉移到一個新的預冷管中,丟棄沉淀。注意:此時細胞裂解產物可長期保存于-80℃。
結合蛋白
4.將40μl平衡好的Flag-Nanoab-Magnetic Beads加入到細胞裂解產物中(可在細胞裂解產物中直接加入40μl該產品),于4℃旋轉混合結合1小時。根據實驗需要可調整結合時間。如果需要,留存50μl的裂解產物進行免疫印跡分析。
5.在磁力架上分離磁珠直到上清變成清亮的狀態,丟棄上清液。如果需要,留存50μl上清液進行免疫印跡分析。
清洗珠子
6.用500μl預冷的裂解緩沖液中重懸5中的Flag-Nanoab-Magnetic Beads,在磁力架上分離磁珠直到上清變成清亮的狀態,丟棄上清液并重復清洗3次。盡量減少清洗時間。
洗脫蛋白
方法一:
7.加入20μl 2×SDS-sample buffer重懸Flag-Nanoab-Magnetic Beads。95℃,加熱10min充分變性,在磁力架上進行分離,收集的產物可進行SDS-PAGE及免疫印跡分析。
方法二:
8.加入50μl 0.2 M pH2.5的gan氨酸洗脫結合的蛋白,孵育時間30秒,期間不斷混勻,在磁力架上進行分離并收集上清,立即加入5μl 1.0 M Tris(pH10.4)以中和酸性的gan氨酸。
注意:為了提高洗脫效率可以重復這一步。
方法三:
9. 加入40µM Flag-peptide進行洗脫。
可選實驗方案
方案一:
如需進行Flag融合酶的活性檢測,無需洗脫,可以直接檢測。
方案二:
如需進行染色質免疫沉淀(ChIP)實驗,主要用于含有Flag融合蛋白的蛋白質/DNA相互作用的實驗。染色質免疫沉淀一般包括細胞固定,染色質斷裂,染色質免疫沉淀,聯反應的逆轉,DNA的純化以及DNA的鑒定。其中前期細胞固定,染色質斷裂不變;然后接著直接進入說明書的第4步,加入細胞裂解產物后,DNA-蛋白質復合物結合到Flag-Nanoab-Magnetic Beads上;
進入第5和6步,分離得到復合物;進入第8步,得到洗脫的復合物;后期交聯反應的逆轉,DNA的純化及DNA的鑒定等同于普通的ChIP實驗。RNA結合蛋白免疫沉淀(RIP)實驗步驟同上。
方案三:
Flag-Nanoab-Magnetic Beads不僅可以用于在體內外檢測和驗證蛋白質之間的相互作用,也可以結合質譜分析篩選與已知蛋白相互作用的未知蛋白。其操作步驟同免疫沉淀法,得到洗脫的復合物后,然后進行SDS–PAGE分析,用考馬斯亮藍或者銀染的方法染色后,切下未知蛋白的條帶,用質譜技術鑒定未知蛋白。