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RNA-PULLDOWN
RNA 與蛋白質相互作用是細胞生理過程中的重要步驟,其中 RNA pull-down 實驗用于研究 RNA 分子與蛋白質之間的相互作用關系。
該方法利用特定標記的 RNA 探針(biotinylated RNA)結合目標蛋白質,形成 RNA-蛋白質復合物,并通過親和純化形式富集出 RNA 與蛋白質復合物,洗脫實驗后可以通過 Western blot 或質譜等技術鑒定 RNA 與蛋白質的結合情況。
實驗原理
RNA pull-down 實驗基于 RNA 與蛋白質的特異性互相識別和結合,通過連接生物的素分子的 RNA 寡核苷酸可以特異性地結合目標蛋白質。富集 RNA 與蛋白質之間的相互作用復合物后,可通過 Western blot 或質譜等技術進一步研究 RNA 與蛋白質的結合情況。
應用途徑
RNA-PULLDOWN實驗可以用于研究 RNA 與蛋白質之間的相互作用。其重要應用包括鑒定 RNA 與蛋白質復合物中的成員、篩選 RNA 結合蛋白質的靶標,以及研究 RNA 參與的基因表達調控機制等。