質譜儀器分析是先將物質離子化,按離子的質荷比分離,然后測量各種離子譜峰的強度而實現分析目的的一種分析方法.以檢測器檢測到的離子信號強度為縱坐標,離子質荷比為橫坐標所作的條狀圖，就是我們常見的質譜圖.

質譜分析儀器-質譜圖術語
質荷比：離子質量(以相對原子量單位計)與它所帶電荷(以電子電量為單位計)的比值,寫作m/Z.
峰：質譜圖中的離子信號通常稱為離子峰或簡稱峰.
離子豐度：檢測器檢測到的離子信號強度.
基峰：在質譜圖中,質荷比范圍內強度大的離子峰稱作基峰.
總離子流圖：質量色譜圖;準分子離子;碎片離子;多電荷離子;同位素離子
總離子流圖：在選定的質量范圍內,所有離子強度的總和對時間或掃描次數所作的圖,也稱TIC圖.
質量色譜圖：某一質量(或質荷比)的離子其強度對時間所作的圖.
利用質量色譜圖來確定特征離子,在復雜混合物分析及痕量分析時，是LC/MS測定中有用的方式.當樣品濃度很低時，LC/MS的TIC上往往看不到峰,此時,根據得到的分子量信息,輸入M+1或M+23等數值,觀察提取離子的質量色譜圖,檢驗直接進樣得到的信息是否在LC/MS上都能反映出來,確定LC條件是否合適,以后進行MRM等其他掃描方式的測定時可作為參考.
準分子離子：指與分子存在簡單關系的離子,通過它可以確定分子量.液質中常見的準分子離子峰是[M+H]+ 或[M-H]- .
在ESI中, 往往生成質量大于分子量的離子如M+1,M+23,M+39,M+18......稱準分子離子,表示為:[M+H]+,[M+Na]+等
碎片離子：準分子離子經過一級或多級裂解生成的產物離子.
碎片峰的數目及其豐度則與分子結構有關,數目多表示該分子較容易斷裂,豐度高的碎片峰表示該離子較穩定,也表示分子比較容易斷裂生成該離子.
Ephedrine, MW = 165
多電荷離子：指帶有2個或更多電荷的離子,常見于蛋白質或多肽等離子.有機質譜中,單電荷離子是絕大多數,只有那些不容易碎裂的基團或分子結構-如共軛體系結構-才會形成多電荷離子.它的存在說明樣品是較穩定的.采用電噴霧的離子化技術,可產生帶很多電荷的離子,后經計算機自動換算成單質/荷比離子.
同位素離子：由元素的重同位素構成的離子稱為同位素離子.
各種元素的同位素,基本上按照其在自然界的豐度比出現在質譜中,這對于利用質譜確定化合物及碎片的元素組成有很大方便, 還可利用穩定同位素合成標記化合物,如:氘等標記化合物,再用質譜法檢出這些化合物,在質譜圖外貌上無變化,只是質量數的位移,從而說明化合物結構,反應歷程等。

質譜分析儀器-質譜圖的確定
(1)確定分子離子,即確定分子量
氮規則:含偶數個氮原子的分子,其質量數是偶數,含奇數個氮原子的分子,其質量數是奇數.與高質量碎片離子有合理的質量差,凡質量差在3~8和10~13,21~25之間均不可能,則說明是碎片或雜質.
(2)確定元素組成,即確定分子式或碎片化學式
高分辨質譜可以由分子量直接計算出化合物的元素組成從而推出分子式
低分辨質譜利用元素的同位素豐度,例:
(3)峰強度與結構的關系
豐度大反映離子結構穩定
在元素周期表中自上而下,從右至左,雜原子外層未成鍵電子越易被電離,容納正電荷能力越強,含支鏈的地方易斷,這同有機化學基本一致,總是在分子薄弱的地方斷裂.
不同類型有機物有不同的裂解方式
相同類型有機物有相同的裂解方式,只是質量數的差異需要經驗記憶.