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PerkinElmer唾液樣品優(yōu)化方案之利器—珠磨均質(zhì)器

來(lái)源:北京平利洋醫(yī)療設(shè)備有限公司   2021年07月21日 16:15  

實(shí)驗(yàn)案例



日前來(lái)自美國(guó)佐治亞州奧古斯塔大學(xué)Augusta University的多位科學(xué)家利用PerkinElmer的SAR-CoV-2檢測(cè)方案對(duì)來(lái)多個(gè)自醫(yī)療機(jī)構(gòu)和社區(qū)收集到的429份對(duì)應(yīng)的鼻咽拭子和唾液樣品進(jìn)行檢測(cè),以分析唾液樣品、鼻咽拭子的檢測(cè)效果,以及利用唾液樣品檢測(cè)優(yōu)化方案后的檢測(cè)效果。


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樣本處理和SARAS-CoV-2分析工作流程示意圖概述:對(duì)在醫(yī)療機(jī)構(gòu)和社中采集的對(duì)應(yīng)鼻咽拭子和唾液樣本進(jìn)行測(cè)試和驗(yàn)證。1、U方案:使用U方案對(duì)鼻炎拭子或唾液樣本進(jìn)行SARS-CoV-2檢測(cè)流程(唾液樣品不經(jīng)過(guò)均質(zhì),直接用于RNA提取);2、SalivaAll方案:使用SalivaAll方案對(duì)唾液樣本進(jìn)行核酸檢測(cè)流程(在唾液樣品提取RNA之前利用珠磨機(jī)均質(zhì)器進(jìn)行唾液均質(zhì)化步驟);3、SalivaAll混樣方案:唾液樣本均質(zhì)后按5:1進(jìn)行混樣,然后進(jìn)行RNA提取、RT-PCR檢測(cè)。


實(shí)驗(yàn)流程及結(jié)果如下


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U方案通過(guò)RT-PCR檢測(cè)240個(gè)對(duì)應(yīng)的鼻咽拭子和唾液樣本的SARS-CoV-2。結(jié)果顯示 28.3%(68/240)的樣本從唾液、鼻咽拭子或兩者中檢測(cè)出SARS-CoV-2陽(yáng)性。唾液中的檢出率50.0%(34/68)低于鼻咽拭子的檢出率89.7%(61/68)。


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SalivaAll方案對(duì)189個(gè)對(duì)應(yīng)的鼻咽拭子和唾液樣本進(jìn)行了檢測(cè),在提取RNA之前利用BeadBoost珠磨均質(zhì)器對(duì)唾液樣品進(jìn)行樣本均質(zhì)化步驟,然后進(jìn)行核酸提取、RT-PCR。結(jié)果顯示,50.2%(95/189)的樣本從唾液、鼻咽拭子或兩者中檢測(cè)出SARS-CoV-2陽(yáng)性。唾液中SARS-CoV-2的檢出率97.8%(93/95)高于鼻咽拭子檢出率78.9%(75/95)。


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U方案與SalivaAll方案比較:對(duì)U方案檢測(cè)的85份唾液樣本用SalivaAll方案再次進(jìn)行檢測(cè),對(duì)兩種方案進(jìn)行評(píng)估。在兩種方案評(píng)估的85份唾液樣本中,57.6%(49份)的SARS-CoV-2檢測(cè)呈陽(yáng)性,在U方案、SalivaAll方案或兩者皆有。唾液樣品SalivaAll方案的檢出率為100%(49/49),而U方案的檢出率為36.7%(18/49)。


SalivaAll混樣方案根據(jù)FDA5:1的混樣建議,分別利用1個(gè)陽(yáng)性樣品和4個(gè)陰性樣品混成陽(yáng)性混樣,利用5個(gè)陰性樣品混成陰性混樣。陽(yáng)性混樣和陰性混樣各混20個(gè)樣品。利用SalivaAll混樣方案,唾液樣本均質(zhì)后每個(gè)樣品取60ul進(jìn)行混樣,5個(gè)樣品總體積為300ul混樣,然后進(jìn)行RNA提取、RT-PCR檢測(cè)。結(jié)果顯示,20個(gè)陽(yáng)性混樣的檢測(cè)準(zhǔn)確性為95%,陰性混樣的檢測(cè)準(zhǔn)確性為100%。


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研究表明傳統(tǒng)的SARS-CoV-2核酸檢測(cè)流程在唾液樣本的操作和檢測(cè)靈敏度等方面具有一定的挑戰(zhàn)。通過(guò)PerkinElmer優(yōu)化的唾液樣品檢測(cè)方案,在RNA提取之前加上唾液樣品均質(zhì)處理步驟,檢測(cè)結(jié)果靈敏性大幅提升,檢測(cè)靈敏度高于鼻咽拭子,同時(shí)可以對(duì)唾液樣品進(jìn)行混樣檢測(cè)。


此款珠磨均質(zhì)器先進(jìn)技術(shù)來(lái)自O(shè)MNI International公司,PerkinElmer已于 2021年1月正式收購(gòu)OMNI International,這是一家專業(yè)的樣品均質(zhì)技術(shù)公司。OMNI的珠磨均質(zhì)技術(shù)是PerkinElmer新推出并獲CE認(rèn)證的SARS-CoV-2唾液檢測(cè)流程的一個(gè)關(guān)鍵組成部分。進(jìn)一步完善了PerkinElmer基因組學(xué)全流程解決方案。PerkinElmer致力于為客戶提供滿足其科研和臨床測(cè)試需求的完整解決方案。


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