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液相色譜柱的損壞70-80%都是由于柱壓升高導致的，色譜柱使用了一段時間以后，壓力會有所升高，達到一定程度以后色譜柱就會報廢，如果在一天之內壓力升高了2-5個mpa，或者在幾次使用后壓力就翻倍的升高，這些都是異常狀況，那建議進行排除。
一、色譜柱保存不當
原因：色譜柱如較長時間不用，重新啟用后需按說明書的活化方法重新活化后再使用，否則也會出現柱壓升高，柱效下降。
解決辦法：按說明書重新活化色譜柱。
原因：除另有規定外，一般反相色譜柱都需保存在高比例有機相中，以防止微生物滋生。否則，重新啟用時，會因微生物滋生而導致柱壓異常升高。
解決辦法：這種情況，可以嘗試用乙腈-水-TFA=50-50-0.1低流速過夜沖洗色譜柱。
二、樣品污染
原因：待檢測樣品成分復雜，部分成分死吸附在柱頭端，導致柱壓升高，柱效下降。 6.2 解決辦法
解決辦法1：中藥項目往往樣品會比較臟，使用一定時間后，會因柱頭污染導致色譜柱性能下降，這種情況下，可將色譜柱反接并按說明書的異常沖洗方法進行沖洗。
解決辦法2：加保護柱，保護柱為一種犧牲式攔截污染，有一定的使用壽命。做的過程中關注柱壓，如柱壓升高10%，則需更換保護柱芯。有些柱溫箱無法放入保護柱，則可償試將保護柱接在柱前，進樣品后，但這種情況需對比不加保護柱的分析圖譜，確定沒有因保護柱與檢測色譜柱的柱溫差異而產生色譜圖差異的情況下，才可以使用。
解決辦法3：檢測樣品建議采用小孔徑的濾頭或濾膜(如0.22μm)進行過濾后再進樣，以盡量減少污染物進入色譜柱。
解決辦法4：定期維護色譜柱(確認為樣品污染導致柱效下降，而不是填料塌陷的)：對于確認是樣品污染導致色譜柱使用一段時間柱效下降的，建議對該項目使用的色譜柱反接后按說明書的異常再生方法進行定期維護；這種處理的好處是，能減少柱子污染物聚集，延長色譜柱使用壽命。
當一根柱子經過異常再生后，性能參數仍無法滿足檢測，說明色譜柱已接近壽命，這種情況下，可以將柱子反接檢測，還能再用一段時間。
檢測蛋白類樣品，容易因蛋白聚集導致柱壓升高，柱效下降，這種情況，可以用乙腈-水-TFA=50-50-0.1低流速過夜沖洗色譜柱。
三、其他原因
仔細檢查系統及操作，根據具體的原因采取相應的措施。
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