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DNA合成儀有不同的類型，包括實驗室型、工業(yè)型和大規(guī)模合成型。實驗室型合成儀主要用于生物實驗室中，而工業(yè)型合成儀主要用于大型生物實驗室以及商業(yè)機構(gòu)中。大規(guī)模合成司則主要用于生物醫(yī)藥原料藥制備領(lǐng)域，可以進行規(guī)模化量產(chǎn)。
用于和DNA或RNA結(jié)構(gòu)類似的寡核苷酸合成的自動化儀器，即是DNA合成儀。通常用于固相合成法，每次在長的寡核苷酸鏈上接入一個核苷酸。加入每一個核苷酸均通過相同的化學反應(yīng)和相應(yīng)的**或嘧啶堿基衍生物作用。儀器不同，所用化學反應(yīng)和操作細節(jié)也會隨之發(fā)生變化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了廣泛的應(yīng)用。
DNA合成儀一般需堿基瓶組及試劑瓶組。試劑瓶組一般最少為6個，含脫保護劑（Deb）、活化劑（act）、蓋帽試劑A（capA）、蓋帽試劑B(capB)、氧化劑（OXI）及洗脫乙腈（ACN），每種儀器一般都多設(shè)置1-2個試劑瓶位，用于特殊產(chǎn)物的合成。堿基瓶組一般最少為4個標準堿基（A/C/G/T）,同時搭配2-多個特殊堿基瓶位，用于熒光標記等合成。
DNA 合成儀采用一定壓力的惰性氣體(氬氣)或氮氣及電磁閥組驅(qū)動液體試劑，也可采用氦氣驅(qū)動試劑。某些合成儀采用slider block滑塊系統(tǒng)及精密蠕動泵，可不采用氣體為驅(qū)動系統(tǒng)。采用氣體及電磁閥驅(qū)動液體試劑時，需先將管路系統(tǒng)電磁閥前段，含試劑瓶組中壓力加壓到規(guī)定氣壓，通過合成管理軟件或手動打開電磁閥(一般打開時間為數(shù)ms)，即可驅(qū)動液體試劑到所需的合成柱中。
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