單細胞基因組學(xué)和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)取得新進展,支原體祛除噴霧助力科研
單細胞基因組學(xué)是一個精密的科研學(xué)科,每一個單獨的細胞都彌足珍貴,包含著多樣的遺傳信息,是打開生命科學(xué)一把鑰匙。在進行單細胞基因組學(xué)的實驗室中,確保實驗環(huán)境的純凈、避免細胞污染十分重要。德國MB公司生產(chǎn)的Mycoplasma Off,高效清除實驗環(huán)境中的支原體、細菌等微生物污染
單細胞基因組學(xué)提供了一種強大的方法來了解變異如何影響基因表達,特別是在人類大腦中眾多細胞類型中。此外,它可能會改善我們對大腦相關(guān)特征的調(diào)節(jié)機制的理解。然而,需要具有廣泛腦表型的群體規(guī)模隊列來推斷變體之間的關(guān)鍵關(guān)聯(lián),并在單細胞規(guī)模上開發(fā)調(diào)節(jié)模型。
近日,科研人員為了解決這個問題,對受實驗者進行了許多單細胞實驗[單核RNA測序(snRNA-seq)、snATAC-seq (ATAC,轉(zhuǎn)座酶可及染色質(zhì)測定)和snMultiome +基因分型]和前額葉皮層樣本的計算分析。
相關(guān)研究成果發(fā)表在《Science》上,文章標(biāo)題為:“Single-cell genomics and regulatory networks for 388 human brains”。科研人員使用單核RNA測序 (snRNA-seq)、單核ATAC-seq測序及單核Multiome測序,并結(jié)合基因分型和計算分析,對含超過280萬個單細胞核在內(nèi)的388份人腦前額葉皮層樣本進行了深度測序,并結(jié)合深度學(xué)習(xí)模型、eQTL (表達數(shù)量性狀位點),構(gòu)建了細胞類型特異性的基因調(diào)控和細胞間通訊網(wǎng)絡(luò),揭示了不同細胞類型在老齡化和神經(jīng)精神疾病中的特定改變。
該項研究的人類大腦的人口規(guī)模單細胞資源,可以幫助促進神經(jīng)精神疾病的精確醫(yī)學(xué)方法,特別是通過優(yōu)先考慮與細胞類型相關(guān)的后續(xù)基因和藥物靶點。
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