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顯微鏡的機械裝置是顯微鏡的重要組成部分。其作用是固定與調節光學鏡頭，固定與移動標本等。主要有鏡座、鏡臂、載物臺、鏡筒、物鏡轉換器、與調焦裝置組成。
（一）、鏡座和鏡臂
1、鏡座 作用是支撐整個顯微鏡，裝有反光鏡，有的還裝有照明光源。 2、鏡臂 作用是支撐鏡筒和載物臺。分固定、可傾斜兩種。
（二）、載物臺（又稱工作臺、鏡臺）
載物臺作用是安放載玻片，形狀有圓形和方形兩種，其中方形的面積為120mm×110mm。中心有一個通光孔，通光孔后方左右兩側各有一個安裝壓片夾用的小孔。分為固定式與移動式兩種。有的載物臺的縱橫坐標上都裝有游標尺，一般讀數為0.1mm，游標尺可用來測定標本的大小，也可用來對被檢部分做標記。
（三）、鏡筒
鏡筒上端放置目鏡，下端連接物鏡轉換器。分為固定式和可調節式兩種。機械筒長（從目鏡管上緣到物鏡轉換器螺旋口下端的距離稱為鏡筒長度或機械筒長）不能變更的叫做固定式鏡筒，能變更的叫做調節式鏡筒，新式顯微鏡大多采用固定式鏡筒，產顯微鏡也大多采用固定式鏡筒，產顯微鏡的機械筒長通常是160mm。
安裝目鏡的鏡筒，有單筒和雙筒兩種。單筒又可分為直立式和傾斜式兩種，雙筒則都是傾斜式的。其中雙筒顯微鏡，兩眼可同時觀察以減輕眼睛的疲勞。雙筒之間的距離可以調節，而且其中有一個目鏡有屈光度調節（即視力調節）裝置，便于兩眼視力不同的觀察者使用。
（四）、物鏡轉換器
物鏡轉換器固定在鏡筒下端，有3—4個物鏡螺旋口，物鏡應按放大倍數高低順序排列。旋轉物鏡轉換器時，應用手指捏住旋轉碟旋轉，不要用手指推動物鏡，因時間長容易使光軸歪斜，使成像邊壞。
（五）、調焦裝置
顯微鏡上裝有粗準焦螺旋和細準焦螺旋。有的顯微鏡粗準焦螺旋與裝在同一軸上，大螺旋為粗準焦螺旋，小螺旋為細準焦螺旋；有的則分開安置，位于鏡臂的上端較大的一對螺旋為是粗準焦螺旋，其轉動一周，鏡筒上升或下降10mm。 位于粗準焦螺旋下方較小的一對螺旋為細準焦螺旋，其轉動一周，鏡筒升降值為0.1mm，細準焦螺旋調焦范圍不小于1.8mm。
顯微鏡及其部件的使用
1、使用單筒顯微鏡時，要養成用左眼觀察的習慣（因一般用右手畫圖），觀察時要兩眼同時睜開，不要睜一只閉一只，因為這樣易于疲勞。為了訓練學生習慣于兩眼同時睜開觀察，可剪一塊長約14cm，寬約6cm的長方形硬紙片，在靠近左端處挖一個直徑比鏡筒上端外徑略小的圓孔，把圓孔套在鏡筒上段，觀察時兩眼同時睜開，利用紙片的右端擋住右眼的視線，這樣訓練一段時間后，就能習慣于兩眼同時睜開，然后把紙片去掉。
2、直筒顯微鏡的鏡臂與鏡座連接處，是一個機械關節，可用于調節鏡筒的傾斜度，便于觀察，鏡臂不能過于后傾，一般不超過40°。但是在使用臨時裝片觀察時，禁止使用傾斜關節（當鏡筒傾斜時，載物臺也隨之傾斜，載玻片上的液體易流出），尤其是裝片內含酸性試劑時嚴禁使用，以免污損鏡體。
3、目鏡和物鏡的使用
一般都是用一個放大倍數適中的目鏡（10×）和低倍的物鏡開始觀察，逐步改用倍數較高的物鏡，從中找到符合實驗要求的放大倍數。 轉換物鏡時，先用低倍鏡觀察，調節到正確的工作距離（成像清晰）。如果進一步使用高倍物鏡觀察，應在轉換高倍物鏡之前，把物像中需要放大觀察的部分移視野中央（將低倍物鏡轉換成高倍物鏡觀察時，視野中的物像范圍縮小了很多）。低倍物鏡和高倍物鏡基本齊焦（同高調焦），在用低倍物鏡觀察清晰時，換高倍物鏡應可以見到物像，但物像不一定很清晰，可以轉動細準焦螺旋進行調節。
通常認為，使用任何一個物鏡時，有效放大倍數的上限是1，000乘它的數值孔徑，下限是250乘它的數值孔徑。如40×物鏡的數值孔徑是0.65，則上、下限分別為：1000×0.65=650倍和250×0.65≈163倍，超過有效放大倍數上限的叫做無效放大，不能提高觀察效果。低于下限的放大倍數則人眼無法分辨，不利于觀察。一般實用的放大倍數范圍是500—700乘數值孔徑之間的數字
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