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上海金鵬分析儀器有限公司針對WB做不好的常見問題分析與解決方案：
| 問題 | 可能原因 | 驗證或解決辦法 |
背景較高 | 封閉不充分 | 延長封閉時間，更換合適的封閉劑(脫脂奶粉，BSA,血清等) |
| 一抗濃度過高 | 增加一抗稀釋倍數， | |
| 抗體孵育溫度過偏高 | 建議4℃孵育 | |
| 二抗非特異性結合 或與封閉劑交叉反應 | 設置二抗對照(不加一抗),降低二抗濃度 | |
| 一抗或二抗與封閉劑有交叉反應 | 在孵育和洗滌液中加入Tween-20以減少交叉反應. | |
| 洗膜不充分 | 增加洗滌次數 | |
| 膜不合適 | NC膜比PVDF膜背景低 | |
| 膜干燥 | 保證充分的反應液，避免出現干膜現象 | |
沒有陽性條帶 或很弱 | 一抗、二抗等不匹配 | 訂購試劑時認真選取一抗與組織種屬， 一抗與二抗或/和底物與酶 系統之間相匹配的抗體及底物。可通過設置內參可以驗證二級檢測 系統的有效性。 |
| -抗或/和二抗濃度低 | 增加抗體濃度，延長孵育時間 | |
| 封閉劑與一抗或二抗有交叉反應 | 封閉時使用溫和的去污劑，如TWEEN20,或更換封閉劑(常用的 脫脂奶、BSA、血清或明膠 | |
| 一抗不識別目的物種的靶蛋白 | 檢查說明書，或做ClustalW比對，設陽性對照 | |
| 樣本中無靶蛋白或靶蛋白含量過 低(抗原無效) | 設置陽性對照，如果陽性對照有結果，但標本沒有則可能是標本中 不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。后者可增加標本上樣量至少每孔 20-30ug蛋白，樣本制備時使用蛋白酶抑制劑，或分級提取目的蛋白。 | |
| 轉膜不充分，或洗膜過度 | 使用麗春紅S檢測轉膜效果，PVDF膜需浸透，需正確的轉膜操作，勿 過度洗膜 | |
| 過度封閉 | 使用含0.5%脫脂奶或無脫脂奶的抗體稀釋液，或更換封閉劑，減少 封閉時間 | |
| 一抗失效 | 使用有效期內抗體，分裝保存，避免反復凍融取用，工作液現配現用 | |
| 二抗受疊氮鈉抑制 | 所用溶液和容器中避免含有疊氮鈉(HRP的抑制劑) | |
| 酶和底物失效 | 直接將酶和底物進行混合，如果不顯色則說明酶失活了、選擇在有 效期內、有活性的酶聯物，使用新鮮的底物. | |
| 曝光時間過短 | 延長曝光時間 | |
多非特異性條 帶 或條帶位置不 對 | 細胞傳代次數過多，使其蛋白表 達模式的分化 | 使用原始或傳代少的細胞株，或平行實驗 |
| 體內表達的蛋白樣本具有多種修 飾形式：乙酰化、磷酸化、甲基 化、烷基化、糖基化等 | 查文獻，使用去修飾的試劑使蛋白恢復其正確的大小 | |
| 蛋白樣本降解 | 使用新鮮制備的標本，并使用蛋白酶抑制劑 | |
| 新蛋白或同族蛋白的分享同種表 位的不同剪接方式 | 查其它文獻報導，或BLAST搜尋，使用說明書報導的細胞株或組織 | |
| 一抗濃度過高 | 降低抗體濃度，可以減少非特異性條帶 | |
| 二抗濃度過高產生非特異性結合 | 降低抗體濃度，增加二抗對照 選擇特異性更強，只針對重鏈的二抗 | |
| 抗體未純化 | 使用單克隆或親和純化的抗體，減少非特異條帶 | |
| 蛋白存在二聚體或多聚體 | SDS-PAGE電泳上樣前，煮沸10 min, |
| 以增強蛋白質解聚變性 | ||
| 背景有白色/黑 色斑點 | 轉膜時有氣泡或抗體分布不均 | 盡量去除氣泡，抗體孵育時保持搖動 |
| 抗體與封閉劑結合 | 過濾封閉劑 | |
| 暗片現白條帶 | 一抗或二抗加入過多 | 稀釋抗體的濃度 |
| 目的條帶過低/ 過高 | SDS-PAGE膠濃度選擇不合適 | 調整膠濃度，分子量大的蛋白用低濃度膠，分子量小的蛋白用高濃 度膠 |
| “微笑”條帶 | 遷移過快，電泳溫度過高 | 降低電泳速度，低溫電泳(冷室) |
轉膜不充分 | 膜沒有完quan均勻濕透 | 使用100%methanol漫透膜 |
| 靶蛋白分子量小于10,000 | 選擇小孔徑的膜，縮短轉移時間 | |
| 靶蛋白等電點等于或接近轉移緩 沖液pH值 | |可嘗試使用其他緩沖液如CAPS緩沖液(pH10.5)或使用低pH值緩 沖液如乙酸緩沖液 | |
甲醇濃度過高 | 過高甲醇濃度會導致蛋白質與SDS分離，從而沉淀在凝膠中，同 時會使凝膠收縮或變硬，從而抑制高分子量蛋白的轉移。降低甲醇 濃度或者使用乙醇或異丙醇代替 | |
| 轉移時間不夠Thick gel | 對于厚的膠以及高分子量蛋白需要延長轉移時間 |
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