一、miRNA的合成途徑
在動物細胞核中,miRNA基因的初級轉錄產物Pri-miRNA(長度大約為300~1000 nt)被RNase IIl-Drosha 酶切割成為發夾結構前體 miRNA(Pre-miRNA,長度大約為70~100nt)。經過初步剪切后,Pre-miRNA在轉運蛋白Exportin-5的作用下由細胞核內轉運到細胞質中,然后由另一種RNase Ill-Dicer 酶進一步切割產生成熟的miRNA(長度大約為21~23 nt)。成熟的miRNA與類似RISC的核糖體蛋白結合形成miRNA-RISC復合體,從而引起靶mRNA降解或者翻譯抑制。miRNA參與胚胎發育、細胞分化、細胞增殖、細胞凋亡、細胞死亡、免疫調節以及物質代謝等過程。
植物miRNA的形成過程全部是在細胞核中完成的,不存在Pre-miRNA從細胞核到細胞質轉運過程。首先,細胞核中編碼miRNA的基因在RNA聚合酶II的作用下轉錄形成Pri-miRNA,然后在Dicer酶-DCL1的作用下形成Pre-miRNA,DCL1繼續作用于Pre-miRNA從而形成成熟的miRNA,以上過程均在細胞核中完成。成熟的miRNA或者是在細胞核中與類似RISC的核糖體蛋白結合形成miRNA-RISC復合體,然后被核轉運蛋白HST運送到細胞質中,或者是先被HST運送到細胞質中,再與核糖體蛋白結合形成miRNA-RISC復合體。miRNA影響植物的生長發育、激素的調節、信號的轉導、植物病害和應答環境脅迫。
二、miRNA的特性
miRNA最典型的特性就是兩點--保守性和特異性。
·保守性
miRNA的結構和序列在物種之間幾乎保持不變。
結構的保守性:無論動物體還是植物體,miRNA的生成途徑都是由莖環結構的前體切割成為成熟體;
序列的保守性:miRNA的序列在不同物種中的差距極小。
·特異性
miRNA的表達分布具有時間區別和空間區別。
時間的特異性:在個體不同的發育階段,miRNA的表達量不同;
空間的特異性:在個體的不同組織中,miRNA的表達量不同。
三、miRNA序列查找
常用的查找miRNA數據庫--miRBase和TarBase。
該數據庫提供已發表的miRNA序列,注釋查詢,定位,發卡序列以及命名服務等信息的數據庫。
該數據庫人工搜集了實驗驗證過的miRNA的靶基因,包括在人、小鼠、果蠅、蠕蟲和斑馬魚中的miRNA的靶基因。
四、miRNA產品選擇指南
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