目錄:優利科(上海)生命科學有限公司>>科研試劑盒>>PCR試劑盒>> 水稻內源基因SPS核酸檢測試劑盒
供貨周期 | 現貨 | 規格 | 50T |
---|---|---|---|
貨號 | YLK10407P | 應用領域 | 化工,生物產業 |
主要用途 | 科研實驗 | 保存條件 | 低溫運輸,-20℃保存 |
有效期 | 12個月 | 試劑盒說明 | 不同批號的試劑盒組分不可交互使用 |
水稻內源基因SPS核酸檢測試劑盒
產品名稱:水稻內源基因SPS核酸檢測試劑盒
英文名稱:Diagnostic Kit for SPS Gene DNA(Real-Time PCR Method)
本試劑盒適用于檢測轉基因植物的SPS基因,用于篩查待檢測植物中是否含有SPS成分。其檢測結果僅供參考。
本試劑盒用國家標準的SPS特異性引物和探針,用熒光PCR 技術進行轉基因成分的檢測。
【試劑組成】
名 稱 | 規 格 |
酶液 | 50μL×1管 |
SPS反應液 | 1.0mL×1管 |
SPS陽性質控品 | 50μL ×1管 |
陰性質控品 | 250μL ×1管 |
【運輸及保存】
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為 12 個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫MX3000P/3005P、MJ Opticon2、LightCycler480、Bio-Rad、eppendorf等系列熒光定量PCR檢測儀。
【標本采集】
稱取200g樣品。
【保存和運輸】
上述標本短期內可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過6個月,標本運送應采用0℃冰壺。
【注意事項】
1. 樣品處理(樣本處理區)
1.1 樣本前處理
固體樣本:用粉碎機或冷凍研磨儀將樣品研磨至細粉狀。
1.2 DNA提取
對于固體標本,DNA的提取可以采用SN/T 2584-2010中推薦的方法:
1) 每個樣品取2個平行管。稱取200mg粉碎的樣品,加入1mL預冷至4℃的抽提液,劇烈搖動混勻后,在冰上靜止5min,4℃條件下10000g離心15min,棄上清液;
2) 加入600uL預熱至65℃的裂解液,充分重懸沉淀,在65℃恒溫保持40min,期間顛倒混勻5次;
3) 室溫條件下10000g離心10min,取上清液轉移至新離心管中,加入5uLRNAseA,37℃恒溫30min,分別用等體積苯/酚:異戊醇溶液和三氯jia烷:異戊醇溶液各抽提一次;
4) 室溫條件下,10000g離心10min,取上清液至新離心管,加入三分之二體積的異丙醇,十分之一體積的3mol/L的乙酸鈉溶液(pH=6.5),-20℃放置2-3h;
5) 在4℃條件下,10000g離心15min,棄上清液,用70%乙醇洗滌沉淀一次,倒出乙醇,晾干沉淀;
6) 加入50uL TE(pH8.0)溶解沉淀,所得溶解即為樣品DNA溶液。
也可使用等效的DNA/提取試劑盒。
油脂樣本請直接選用市售油脂DNA/提取試劑盒,按說明操作。
2. 試劑配制(試劑準備區)
根據待檢測樣本總數,設所需要的PCR反應管管數為N(N=樣本數+1管陰性對照+1管陽性對照;樣品每滿7份,多配制1份),每測試反應體系配制如下表:
試劑 | SPS反應液 | 酶液 |
用量 | 20μL | 1μL |
3. 加樣(樣本處理區)
將步驟1提取的DNA、陽性質控品、陰性質控品各取4μL,加入相應的
反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4. PCR擴增(核酸擴增區)
4.1將待檢測反應管置于熒光定量PCR儀反應槽內;
4.2設置好通道、樣品信息,反應體系設置為25ul;熒光通道選擇: 檢測通道(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)選擇NONE,請勿選擇ROX參比熒光。
4.3推薦循環參數設置:
步驟 | 循環數 | 溫度 | 時間 | 收集熒光信號 |
1 | 1 cycle | 95℃ | 10min | 否 |
2 | 40 cycles | 94℃ | 15sec | 否 |
55℃ | 30sec | 是 |
5. 結果分析判定
5.1 結果分析條件設定
設置Baseline和Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出現整體傾斜時,根據分析后圖像調節Baseline的start值(一般可在3~15范圍內調節)、stop值(一般可在5~20范圍內調節),以及Threshold的Value值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
5.2 結果判斷
陽性:檢測通道Ct值≤35,且曲線有明顯的指數增長曲線;
可疑:檢測通道35<Ct值≤38,建議重復檢測,如果檢測通道仍為35<Ct值≤38,且曲線有明顯的增長曲線,判定為陽性,否則為陰性;
陰性:樣本檢測結果Ct值>38或無Ct值。
6. 檢測方法的局限性
樣本檢測結果與樣本收集、處理、運送以及保存質量有關;
樣本提取過程中沒有控制好交叉污染,會出現假陽性結果;
陽性對照、擴增產物泄漏,會導致假陽性結果;
病原體在流行過程中基因突變、重組,會導致假陰性結果;
不同的提取方法存在提取效率差異,會導致假陰性結果;
試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現假陰性或定量檢測不準確的結果;
本檢測結果僅供參考,如須確診請結合臨床癥狀以及其他檢測手段。
7. 質控標準
陰性質控品:Ct>38或無Ct值顯示;
陽性質控品:擴增曲線有明顯指數生長期,且Ct值≤32;
以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
【注意事項】
1.所有操作嚴格按照說明書進行;
2.試劑盒內各種組分使用前應自然融化,wan全混勻并短暫離心;
3.反應液應避光保存;
4.反應中盡量避免氣泡存在,管蓋需蓋緊;
5.使用一次性吸頭、一次性手套和各區專用工作服;
6.樣本處理、試劑配制、加樣需在不同區進行,以免交叉污染;
7.實驗完畢后用10%次氯酸或75%酒精或紫外燈處理工作臺和移液器;
8.試劑盒里所有物品應視為污染物對待,并按照《微生物生物醫學實驗室生物安全通則》進行處理。