目錄:北京蘭博利德商貿有限公司>>分子生物學試劑>>qPCR相關>> R02022x Realab Green PCR Fast mixture通用型
供貨周期 | 現貨 | 規格 | 100T,500T,1000T |
---|---|---|---|
貨號 | R0202 |
Taq SYBR® Green qPCR Premix (通用型)
產品貨號:R0202
儲存條件:長期保存請于 -20℃避光保存,Mix 融解后可在 4℃避光條件下穩定存放一個月,盡量避免反復凍融。
2x Realab Green PCR Fast mixture通用型產品簡介
Taq SYBR® Green qPCR Premix 是 SYBR® Green I 嵌合染料法專用qPCR試劑,為2×預混液,包含除引物和DNA樣品以外的所有qPCR組分,可減少操作步驟,縮短加樣時間,降低污染幾率。其核心組分是經抗體修飾的熱啟動Taq DNA聚合酶,配合精心優化的Buffer體系以及PCR反應促進因子,使產品具有特異性強、擴增效率高等特點,有效抑制非特異性擴增,可對寬廣濃度范圍的模板進行準確定量,獲得穩定可靠的qPCR結果。
2x Realab Green PCR Fast mixture通用型使用方法:
1.適配機型
全機型通用
2.使用注意
① 因Mix中預混有染料,其保存或反應體系配制過程應避免強光照射;
② 使用前上下顛倒輕輕混勻Mix,請勿渦旋振蕩混勻,避免產生過多氣泡。
3.建議的qPCR反應體系
試劑 | 使用量 | 終濃度 |
Taq SYBR® Green qPCR Premix | 10ul | 1× |
正向引物 (10uM)a | 0.4ul | 0.2uM |
反向引物(10uM)a | 0.4ul | 0.2uM |
DNA模板b | X ul | 10~200 ng/20ul |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
a.調通推薦的引物終濃度為0.2uM,反應效果不佳時可在0.1~1uM范圍內進行調整;
b.推過薦模板加樣量的為1~2ul,如模板類型為未稀釋cDNA原液,模板添加量不應超過總反應體系的10%,不同種類DNA模板中含有的靶基因拷貝數目不同,必要時可進行梯度稀釋,以確定必要的DNA模板添加量。
4.qPCR 反應程序(可根據機型適當調整)
兩步法:
三步法:
a.根據引物的Tm值進行退火&延伸(退火)溫度的設定;若擴增片段在200bp以內,退火&延伸(延伸)時間可以設置為15sec;此外,退火&延伸(延伸)時間的設置還需根據您使用的qPCR儀所需的最短數據采集時間自行調整;
b.不同 qPCR 儀的熔解曲線采集程序有差別,一般可使用儀器默認的熔解曲線采集程序。
5.實驗優化
若使用默認反應條件反應性能不佳時,則需要進行反應條件的優化,可以從引物濃度以及擴增程序兩個方面進行:
① 引物濃度調整
當引物終濃度在0.1~1.0uM范圍之間變化時,引物濃度越低,擴增特異性越高,但擴增效率會有所下降。
② 擴增程序優化
需提高擴增特異性,可使用兩步法程序或提高退火溫度;需提高擴增效率,可使用三步法程序或延長延伸時間。
6.引物設計原則
① 擴增產物長度建議控制在80~200bp;
② 引物長度為18~25bp;
③ 正向引物和反向引物的Tm值相差不超過 1℃為佳,Tm值控制在58~62℃為佳;
④ 引物的GC含量控制在 40%~60% 之間;
⑤ 引物A、G、C、T整體分布盡量要均勻,避開T/C或者A/G的連續結構(特別是3'端);
⑥ 引物3'端zuihou一個堿基zuihao為G或者C;
⑦ 避開引物內部或者兩條引物之間的互補序列;
⑧ 使用NCBI BLAST功能檢索確認引物的特異性。
問題描述 | 可能原因 | 解決辦法 |
擴增曲線不光滑 | 熒光信號太弱,經系統校正后產生 | 確保Mix中預混的染料未降解;更換熒光信號收集更好的qPCR專用耗材 |
擴增曲線斷裂或下滑 | 模板濃度較高,基線的終點值大于Cq 值 | 減小基線終點(Cq-4),重新分析數據 |
個別孔擴增曲線突然驟降 | 反應管內留有氣泡 | 確保Mix*溶解,請勿渦旋振蕩混勻 加樣完成后輕彈離心去除氣泡 延長預變性時間至10min,以去除氣泡 |
反應結束無擴增曲線出現 | 反應循環數偏少 | 設置循環數為40,但更多的循環數會增加過多的背景信號 |
熒光信號采集步驟未設置或者設置錯誤 | 兩步法擴增程序一般將信號采集設置在退火&延伸階段,三步法擴增程序應當將信號采集設置在72℃延伸階段 | |
引物可能降解 | 長期未用的引物,應先通過PAGE電泳檢測完整性,以排除其降解的可能 | |
模板濃度過低 | 減少模板稀釋倍數重復實驗,樣品濃度未知的情況下先從higest濃度做起 | |
模板降解 | 重新制備模板,重復實驗 | |
Cq 值出現過晚 | 擴增效率低 | 提高引物濃度,嘗試三步法擴增程序,或者重新設計引物 |
模板濃度過低 | 減少模板稀釋倍數重復實驗,樣品濃度未知的情況下先從GAO濃度做起 | |
模板降解 | 重新制備模板,重復實驗 | |
擴增產物過長 | 擴增產物長度控制在80~200 bp | |
體系中存在 PCR 抑制劑 | 一般為模板帶入,加大模板稀釋倍數或重新制備純度高的模板重復實驗 | |
空白對照出現信號 | 反應體系污染 | 首先更換空白對照的水,如果還發生同樣情況,繼續更換引物、吸頭、PCR 管或啟用新的Mix;反應體系在超凈工作臺內配制,減少氣溶膠污染 |
出現引物二聚體等非特異性擴增 | 一分般析在 35 循環以后空白對照出現擴增產物屬正常情況,應配合熔解曲線進行重新設計引物,調整引物濃度或優化PCR反應程序 | |
熔解曲線出現多峰 | 引物設計不佳 | 根據引物設計原則重新設計新引物 |
引物濃度過高 | 適當降低引物濃度 | |
cDNA 模板存在基因組污染 | 提取后的RNA溶液使用DNA酶進行消化,例如:dsDNase,以去除基因組污染,或設計跨內含子引物 | |
實驗重復性差 | 加樣誤差大 | 使用精準的移液器、配合高品質吸頭準確移液 高倍稀釋模板,加入大體積模板減少加樣誤差 放大qPCR反應體積 |
模板濃度過低 | 減少模板稀釋倍數重復實驗 | |
qPCR儀不同位置的溫度偏差 | 定期校準qPCR儀 |