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全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

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更新時間:2024-12-03 22:47:52瀏覽次數(shù):1205次

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10x Genomics公司Chromium Connect單細胞測序儀器設(shè)備,是一款全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)。可自動化完成從單細胞懸液到可用于測序的文庫制備,從而實現(xiàn)工作效率的提升。簡化后的工作流程將單細胞分離和條形碼與文庫制備相結(jié)合,將手動操作時間從8小時以上縮短到1小時之內(nèi)。同時,自動化工作流程減少了手動移液帶來的誤差,實現(xiàn)了流程標準化,可以產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細胞數(shù)據(jù)。

將您的單細胞工作流程自動化

一、全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)儀器簡介:

(1)單細胞測序儀器設(shè)備Chromium Connect,是一款全自動的單細胞建庫解碼系統(tǒng)。可自動化完成從單細胞懸液到可用于測序的文庫制備,從而實現(xiàn)工作效率的提升,可以專注于更重要的工作。簡化后的工作流程將單細胞分離和條形碼與文庫制備相結(jié)合,將手動操作時間從8小時以上縮短到1小時之內(nèi)。
(2)同時,自動化工作流程減少了手動移液帶來的誤差,實現(xiàn)了流程標準化,可以產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細胞數(shù)據(jù)。結(jié)合Cell Ranger數(shù)據(jù)分析軟件和Loupe Browser可視化軟件,輕松實現(xiàn)單細胞水平轉(zhuǎn)錄組、免疫分析、基因組拷貝數(shù)變異和染色質(zhì)開放性等研究。品牌10x Genomics,型號Chromium,產(chǎn)地新加坡,代理商是斑馬魚(北京)科技有限公司。

全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

二、全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)工作流程:

單細胞測序流程是從單細胞或細胞核懸液開始的。采用*進的微流體技術(shù)生成含有單細胞或細胞核的微滴。接著按照簡化的流程來構(gòu)建文庫。測序后采用整合的數(shù)據(jù)分析流程和可視化軟件來處理和分析數(shù)據(jù)。

全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

三、讓您的效率提升10x:

(1)Chromium Connect將您的單細胞測序流程自動化,包括基因表達和細胞表面蛋白的分析,讓您可以輕松地從細胞直接生成立即可測序的文庫。對于不同的實驗和不同的用戶,該儀器都能夠產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細胞基因表達結(jié)果。
(2)能夠減少手動移液的失誤,將您的手動操作時間從8小時以上縮短到1小時以內(nèi)。這個全面整合且經(jīng)過驗證的解決方案將幫助您充分利用時間,充滿信心地開展單細胞實驗。

全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

四、技術(shù)原理:

Chromium單細胞解決方案能夠從多個角度捕獲細胞活性的分子讀數(shù),包括基因表達、染色質(zhì)可接近性、細胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特異性以及CRISPR編輯。這項技術(shù)的核心之處在于能夠產(chǎn)生成千上萬個單細胞微滴,而每個微滴都含有一個可識別的條形碼,便于下游分析。

全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

五、Next GEM技術(shù):

①每個Chromium解決方案都從高度多樣化的凝膠珠(GelBeads)開始,每個凝膠珠都帶有的寡核苷酸條形碼標簽序列,以及便于捕獲目標分子的功能化序列。

②在Chromium系統(tǒng)內(nèi),將帶有條形碼標簽的凝膠珠與細胞或細胞核、酶以及分液油混合,產(chǎn)生成千上萬個單細胞乳液微滴,這些微滴被稱為“GEM"(Gel Bead-in-emulsion)。

③每個GEM都作為單獨的反應(yīng)微滴,凝膠珠在其中溶解,捕獲每個細胞的目標分子,添加條形碼并擴增。

④添加條形碼后,來自同一細胞或細胞核的所有片段都共享一種10x 條形碼。將成千上萬個細胞的帶有條形碼的產(chǎn)物混合,進行下游反應(yīng),從而產(chǎn)生與短讀長測序儀兼容的文庫。

⑤在測序后,生物信息學(xué)工具將利用可識別的條形碼序列將測序片段定位到原本的單細胞或細胞核。


全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

六、一臺自動化系統(tǒng),多種單細胞分析:

高效分析成千上萬個細胞,通過不同的工作流程揭示細胞異質(zhì)性。一系列單細胞測序分析可選擇連續(xù)流程,也可選擇靈活的模塊化流程,以適應(yīng)您的日常操作。

1. 單細胞基因表達:將您的3’單細胞基因表達工作流程自動化,讓您更高效地探索細胞異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)新的靶點和生物標志物,并闡明復(fù)雜的細胞進程。

2.單細胞免疫分析:將您的5’基因表達和V(D)J擴增流程自動化,并可選擇采用Feature Barcode技術(shù)同時測定細胞表面蛋白表達和抗原特異性,以便大規(guī)模分析免疫系統(tǒng)的細胞異質(zhì)性,以及T細胞和B細胞受體多樣性。

3.也可使用單細胞基因表達與細胞表面蛋白同時分析的5’多組學(xué)免疫分析的自動化工作流程。

4. 技術(shù)培訓(xùn)和支持:Xenium、Visium CytAssist、Chromium Controller,Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑馬魚(北京)科技有限公司是10x Genomics代理商,負責(zé)銷售儀器和試劑,具備豐富的單細胞測序和空間轉(zhuǎn)錄組實驗方面經(jīng)驗,可為用戶提供單細胞懸液制備,建庫,測序,生信分析等一整套解決方案。在購買儀器后,將安排有資質(zhì)的工程師進行現(xiàn)場安裝和培訓(xùn)。培訓(xùn)內(nèi)容包括樣本制備、儀器操作、數(shù)據(jù)分析。在培訓(xùn)完成后,客戶還將獲得支持,包括遠程技術(shù)支持(Technical Support)、現(xiàn)場應(yīng)用科學(xué)家(FAS)、現(xiàn)場服務(wù)工程師(FSE)和生物信息學(xué)應(yīng)用(Applied Bioinformatics)團隊,覆蓋實驗工作流程、試劑耗材、儀器和軟件的各個方面。

全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

七、單細胞分離、標記和文庫制備集成于一臺經(jīng)過優(yōu)化的儀器中:

集成了專為單細胞流程而定制的組件、自動化專屬的試劑和耗材,以及輕松易用的觸摸屏計算機。從直觀的自行設(shè)置到防出錯的試劑上樣,即便您是新手,也能讓您快速啟動單細胞測序?qū)嶒灐?/span>

全自動單細胞測序建庫解碼系統(tǒng)

八、儀器技術(shù)參數(shù):

1、功能用途:利用微流控芯片對單細胞懸液樣本進行精確分區(qū)并建立油包水反應(yīng)體系,每個反應(yīng)體系含有特定標簽序列,對樣品中的數(shù)千個單細胞mRNA進行建庫,通過對文庫的測序分析,解讀細胞群體的基因表達譜。可自動化完成從單細胞懸液到可用于測序的文庫制備,減少了手動操作誤差,實現(xiàn)了流程標準化,可以產(chǎn)生一致且可重復(fù)的單細胞數(shù)據(jù)。

2、處理樣本類型:一種微流體芯片兼容不同大小及不同類型的真核細胞;

3、簡單的實驗操作流程:從單細胞懸液到測序文庫的生成在8小時內(nèi)可以完成;

4、樣本處理通量:儀器可同時運行1-8個通道,每次運行最多可產(chǎn)生8,0000個單細胞的轉(zhuǎn)錄本;

5、分區(qū)與標簽數(shù):每次運行產(chǎn)生>8萬個納升級分區(qū),含有75萬個序列標簽(每個標簽由16個堿基構(gòu)成);

6、集成工作流程中的步驟,從單細胞partitioning和barcoding到測序文庫生成一站式完成;

7、配備自動化工作流程,易于使用的觸摸屏計算機,簡易的操作方式;

8、通過減少用戶操作之間的差異,獲得一致的單細胞基因表達結(jié)果;

9、從單細胞懸液到測序文庫全自動化生成不超過9小時;

10、手動操作時間≤1小時;

11、配備熱循環(huán)模塊,能自動實現(xiàn)PCR反應(yīng);

12、配備磁力裝置,自動完成清洗工作;

13、配備2D條形碼掃描器,掃描試劑信息并跟蹤試劑使用情況;

14、可以調(diào)節(jié)高度和角度,適合各種類型用戶;

15、軟件包括:免費安裝,免費升級。

九、斑馬魚(北京)科技有限公司,是10x Genomics公司的授權(quán)經(jīng)銷商,負責(zé)產(chǎn)品的推廣銷售和技術(shù)支持,為您提供技術(shù)參數(shù),報價、選型、實驗指導(dǎo)、安裝培訓(xùn)、售后服務(wù)等,更多信息可和我們聯(lián)系


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